美国队长所在的牢房非常牢固，在不触发警报的情况下救出美国队长，需要专业的科技人员才行。
但神盾局的科研人员大部分都被调离，去执行一项和宇宙魔方有关的秘密项目，神盾局高层已经被洛基控制，那个项目应该是洛基的主意。
洛基不知道对宇宙魔方有什么阴谋，将神盾局的科研人员都调走进行宇宙魔方计划。
但现在总部没有科研人员，让科尔森有些头疼，但他还是勉强找到了两个何时的目标，两个刚刚从神盾局学院毕业的‘雏鸟’。
这两个雏鸟就是菲兹和西蒙斯，他们刚刚从学院毕业，因为成绩优异，还有院长的推荐信，所以两人都是五级特工，算是属于实习阶段的科研人员。
科尔森手头上是在找不到人了，只能找到他们两个，死马当活马医了。
当他们两个得知神盾局的真相，神盾局高层都被外星人控制了，美国队长被关押，两个刚从学院毕业的小雏鸟，吓的差点站不稳摔倒。
看到他们两个人的样子，科尔森也是无奈，他实在找不到信得过，没有被洛基控制，也不会被注意到的人。
菲兹和西蒙斯平静心情后，表示一定会帮科尔森的，最近神盾局总部的变化，那种气氛，实际上所有人都察觉到了。
虽然菲兹和西蒙斯刚刚从学院毕业不久，但两人的专业知识是非常过硬的，帮科尔森制造了一种仪器，能够打开关押美国队长的牢门。
科尔森让梅等人寻找能够信任的人，制定逃离计划，打算逃出总部。
洛基等人没想到科尔森等人的计划，科尔森当晚，连夜解救出了美国队长，还找回了美国队长的装备，随后，一行人夺取了空客，从神盾局总部逃了出去。
当基地的警报响起，洛基等人注意到时，一切都已经太晚了，科尔森等人已经逃跑了。
随后，神盾局就发布声明，科尔森等人叛变了神盾局，同时蛊惑了刚刚解冻的美国队长，命令神盾局抓捕叛徒，格杀勿论。
而科尔森等人逃出了神盾局总部后，自己暂时安全了，紧接着就得想办法拯救神盾局。
神盾局的全名是国土战略防御攻击与后勤保障局，这个部门的意义就是一道防线，一道保护全世界，全人类的防线，屹立于人类与诡异、神秘、危险之间的防线，防止人们得知他们还没有准好接受的消息，保护全人类的安全。
比如，绿巨人、神域雷神、异能者、外星生物等等，这些都是人类无法接受，会在社会上造成大面积恐慌和舆论的事实，神盾局将其隔绝，不被民众知晓，暗中解决这些的问题。
但现在守护人类的这道防线，这个盾牌，竟然被外星人夺去了，而且，还不知道这个外星人究竟有什么阴谋计划。
现在不仅仅是神盾局安危的问题，而是关乎整个地球，整个人类的危机。
科尔森暗中联络各地的神盾局特工，声明神盾局总部的情况，但却得不到任何的回应。
面对这种束手无措的情况，科尔森想到了复仇者计划，当初弗瑞局长提出复仇者计划时，就是为了这种情况。
神盾局计划的复仇者联盟的后备人员是‘国王’马科斯、‘钢铁侠’托尼·斯塔克、‘美国队长’史蒂芬·罗杰斯、‘雷神’托尔、‘黑寡妇’娜塔莎·罗曼诺夫、‘鹰眼’克莱特·巴顿和‘绿巨人’布鲁斯·班纳几人。
但现在黑寡妇、鹰眼都被洛基控制，绿巨人也凶多极少，雷神托尔一年前在新墨西哥州一别，回神域后，至今一直都没有消息。
洛基来自神域，是雷神的弟弟，科尔森也不知道神域发生了什么变化，无法指望雷神。
美国队长虽然被科尔森救了出来，但只靠美国队长，是无法从洛基手中拯救神盾局的。
这样下来，科尔森只能将希望寄托在托尼·斯塔克和马科斯两人身上。
但神盾局的特工在监视着斯塔克集团和红缎带工业，科尔森无法接近，无法联络小辣椒，更联系不上马科斯。
科尔森等人一边躲避着神盾局和警方、军方的追捕，一边想办法联络托尼·斯塔克和马科斯，同时关注着神盾局的动向。
科尔森主要想要联络上马科斯，他知道失踪了一年的马科斯回来的消息，而且，托尼·斯塔克去中东找马科斯后，一去不回，好像在中东定居一般。
也幸亏托尼·斯塔克一直在中东，没有回美国，不然托尼·斯塔克恐怕也会遭到不测。
洛基控制了神盾局高层，知晓了神盾局的秘密，知晓了复仇者联盟的事情，黑寡妇、鹰眼和绿巨人都被洛基控制，要不是科尔森的话，美国队长也会遭到洛基的毒手。
要是托尼·斯塔克还在美国的话，洛基肯定不会放过他的，也会将托尼·斯塔克抓起来，用心灵权杖将其控制。
马科斯和托尼·斯塔克两人都远在中东，洛基的手还伸不到那么远。
所以，只要科尔森能联络上马科斯，就能同时联络上托尼·斯塔克。
不过，随着神盾局事变，科尔森的情报就断了，不知道托尼·斯塔克还在不在中东，是不是回美国了。
但就在科尔森想办法，联络马科斯时，神盾局突然大规模出动，立即引起了科尔森等人的警觉。
当发现神盾局要抓捕的扞卫者联盟时，科尔森等人都非常惊讶，没想到神盾局主导的复仇者联盟还没成立，在民间竟然已经有超级英雄团队，而且，为首的人还是布玛。
得知布玛的信息，科尔森心思立即活了起来，在布玛离开红缎带王国时，马科斯给神盾局打过电话，让他们照顾一下布玛，主要是给他们打个预防针，要是布玛惹出什么乱子，让神盾局看在他的面子上，不要太为难布玛。
而当时和马科斯联络的人，就是科尔森，他知道布玛是马科斯的人，只要找到布玛，就能通过布玛联络到马科斯。