就在联盟全力备战的时候，暗影基因帝国的主力舰队突然对联盟的一个边境殖民地发起了攻击。这个殖民地是人类和星核文明共同建立的基因研究基地，拥有数千名居民和科研人员。帝国舰队没有直接发动军事攻击，而是向殖民地投放了大量的 “暗影噬种”。
黑色的噬种能量雾笼罩了整个殖民地，居民和科研人员很快就出现了感染症状。他们的皮肤开始变黑，眼神变得空洞，失去了自主意识，成为了暗影基因帝国的傀儡。殖民地的防御系统被感染的科研人员破坏，帝国舰队顺利占领了殖民地。
“殖民地沦陷了！所有居民都被感染了！” 联盟总部传来紧急通报，附带的画面让所有人都感到震惊 —— 被感染的人们像行尸走肉一样，听从帝国士兵的指挥，销毁研究设备，屠杀未被感染的幸存者。
“暗影噬种的威力比我们预想的还要恐怖！” 林悦的声音带着颤抖，“我们必须尽快救援殖民地的幸存者，阻止噬种的扩散！”
王屿辞的脸色铁青，他立刻下令：“组建救援舰队，携带共生净化炮和联盟共生护盾发生器，立刻前往边境殖民地；同时，通知各联盟文明，加强所有殖民地的防御，防止暗影基因帝国的偷袭。”
救援舰队由 “共生号” 担任旗舰，王屿辞和林悦亲自带队。舰队出发后，很快就抵达了边境殖民地的轨道。此时，殖民地的表面已经被黑色的噬种能量雾完全覆盖，帝国舰队的战舰在轨道上巡逻，阻止任何外来船只靠近。
“启动联盟共生护盾，掩护登陆部队！” 王屿辞下令。
“共生号” 释放出巨大的联盟共生护盾，笼罩了殖民地的一部分区域，将黑色能量雾阻挡在护盾之外。登陆部队乘坐穿梭舱，降落在护盾覆盖的安全区域，建立了临时救援基地。
“派出净化小队，深入殖民地内部，寻找幸存者，使用共生净化炮净化噬种能量！” 林悦下令。
净化小队的成员都植入了最新的强化共生基因，配备了便携式共生净化炮。他们深入殖民地内部，发现大部分建筑都被帝国士兵控制，被感染的人们在街道上巡逻。净化小队小心翼翼地避开巡逻队，寻找未被感染的幸存者。
在一座地下研究室里，净化小队找到了十几名躲在里面的科研人员。他们因为及时关闭了研究室的防护系统，暂时没有被感染，但防护系统的能量已经快要耗尽。
“快跟我们走！” 净化小队的队长喊道。
就在科研人员准备撤离时，一群被感染的居民突然冲进了研究室。他们面目狰狞，朝着净化小队和科研人员扑来。“启动便携式净化炮！” 队长下令。
淡绿色的净化能量束发射出去，击中了被感染的居民。被感染的居民身上的黑色能量雾开始消散，眼神逐渐恢复清明，但身体还很虚弱。“他们的基因链受到了损伤，需要进一步治疗。” 随行的医护人员说道。
净化小队一边保护科研人员撤离，一边净化被感染的居民。但暗影基因帝国的士兵很快就发现了他们，朝着他们发起攻击。帝国士兵使用的基因武器，能够发射黑色的能量弹，击中目标后会加速噬种的感染。
“请求空中支援！” 队长通过通讯器喊道。
联盟舰队的飞船立刻对地面发起攻击，轰炸帝国士兵的阵地。净化小队趁机带着幸存者和被治愈的居民，撤回了临时救援基地。
经过三天的救援，联盟小队共救出了三百多名幸存者，治愈了近千名被轻度感染的居民。但殖民地的大部分区域仍然被帝国控制，暗影噬种的能量雾还在扩散。
“我们不能再这样被动救援了。” 王屿辞在舰队会议上说，“必须主动出击，摧毁帝国舰队的噬种投放装置，净化整个殖民地的噬种能量。”
林悦提出了一个计划：“我们可以利用强化共生基因的‘基因伪装’功能，让一支小队伪装成被感染的居民，潜入帝国舰队的旗舰，摧毁噬种投放装置的核心。”
这个计划虽然危险，但却是目前最有效的方法。王屿辞决定亲自带领小队执行任务。“我是联盟的首席代表，也是强化共生基因的核心载体，我去最合适。” 他坚定地说。
林悦想要阻止，但看到王屿辞的眼神，知道他已经下定了决心。“我和你一起去。” 林悦说，“我们是最佳搭档，一起才能完成任务。”
王屿辞点了点头，不再拒绝。他们挑选了八名精英队员，组成了突击小队。小队成员都激活了强化共生基因的基因伪装功能，皮肤表面出现了黑色的纹路，看起来和被感染的居民一模一样。
夜色降临，突击小队乘坐小型穿梭舱，降落在殖民地的边缘地带，朝着帝国舰队的旗舰方向潜行而去。一场生死攸关的潜入任务，就此开始