纪年范围： 从庚寅年（上章摄提格），到乙未年（旃蒙协洽），共计六年。
世祖光武皇帝（刘秀）中之上 建武六年（庚寅年，公元30年）
春，正月，丙辰（十六日）： 刘秀将家乡舂陵乡升格为章陵县，世代免除章陵百姓的徭役，如同刘邦对待丰邑、沛县一样。
（平定东方）： 吴汉等人攻克朐县，斩杀董宪、庞萌。至此，长江、淮河、崤山以东地区全部平定。各路将领返回洛阳，刘秀设宴款待并给予赏赐。
（战略调整）： 刘秀苦于连年征战，又因隗嚣已派儿子入侍（隗恂），公孙述远据边陲，就对将领们说：“暂且把这两个人（隗嚣、公孙述）放在一边吧。”于是让将领们在洛阳休整，将军队分驻河内郡（作为预备），并多次向陇右（隗嚣）和蜀地（公孙述）传递书信，晓谕祸福，施加压力。
（公孙述与刘秀书信往来）： 公孙述屡次发文书到中原，宣扬自己得到的天命符瑞（图谶），企图迷惑众人。刘秀回信给公孙述说：“图谶上说的‘公孙’，是指汉宣帝（刘询）。取代汉朝的人姓‘当涂’，名‘高’（‘当涂高’暗指魏，是后来的事）；你难道是‘高’本人吗！你又把掌纹当作祥瑞，王莽的作为哪里值得效仿！你不是我的叛臣逆子，只不过是在乱世中人人都想当皇帝罢了。你年纪已老，妻子儿女弱小，应当早做打算。天下帝位（神器），不是靠强力争夺的，你要三思！”刘秀在信后署名“公孙皇帝”。公孙述没有回信。
（荆邯献策）： 公孙述的骑都尉、平陵人荆邯劝说他：“汉高祖（刘邦）出身于行伍，多次兵败身陷困境；然而败后重整旗鼓，伤愈再战。为什么？因为冒死前进才能成功，比退却灭亡强！隗嚣遇到好时机，割据雍州，兵强马壮，士人归附，威震崤山以东；碰上更始帝政事混乱，又失去天下，百姓伸长脖子盼望明主，四方分崩离析，隗嚣不在这时乘危冒险去争夺天下，反而退一步想效仿周文王（西伯），尊崇儒家经典，招纳处士宾客，停息战争，谦卑地事奉汉朝，感慨地自以为文王再世！现在汉帝（刘秀）解除了关、陇（隗嚣）的忧患，专心向东（指平定东方）用兵，天下他已占四分之三；再派出秘密使者，招降怀有二心的人（指隗嚣部属），使西州（陇右）豪杰都心向崤山以东（指归附刘秀），那么他就拥有五分之四的天下；如果汉军出兵天水（隗嚣根据地），隗嚣必定溃败，天水一旦平定，汉朝就拥有九分之八的天下了。陛下您仅凭梁州（益州）之地，对内要供奉天子（指维持帝位），对外要供给三军，百姓忧愁困苦，无法承受朝廷的赋役，恐怕会发生像王莽那样内部崩溃的变故！臣的愚见，认为应该趁天下人心尚未断绝，豪杰还可以招纳引诱的时机，火速派出国内精兵，命令田戎占据江陵，控制长江以南的枢纽，依靠巫山的险固，修筑堡垒坚守，向吴、楚地区传发檄文，长沙以南地区必定望风归降。命令延岑出兵汉中，平定三辅地区，天水、陇西就会拱手臣服。这样，天下震动，我们就有希望获得大利。”公孙述征求群臣意见，博士吴柱说：“周武王讨伐商纣，八百诸侯不约而同响应，尚且回师等待天命（指孟津观兵）。没听说过没有左右诸侯的帮助，就出兵千里之外的事。”荆邯反驳：“现在东帝（刘秀）没有一尺一寸的权柄（指根基尚浅），驱赶着乌合之众，冲锋陷阵，所向披靡。我们不赶快乘此机会与他争夺天下，却坐在这里空谈武王伐纣的旧事，这是又效仿隗嚣想做周文王啊！”公孙述认为荆邯说得对，打算征发全部北军（禁卫军）和山东（崤山以东）的客兵（指依附他的东方武装），派延岑、田戎分两路出兵，与汉中各将领合兵一处。但蜀地人士和公孙述的弟弟公孙光认为不该倾全国之力远征千里，把成败押在一战上，极力劝阻，公孙述才作罢。延岑、田戎也多次请求带兵出征立功，公孙述始终疑虑不允，只有公孙氏的人才能掌权。公孙述废除铜钱，设置铁钱，导致货币不能流通，百姓深受其苦。他处理政事苛求细节，像当年当清水县令时一样（指格局小）。喜欢更改郡县官名。他年轻时做过郎官，熟悉汉朝旧制，出行时使用皇帝的仪仗（法驾），有鸾旗和旄头骑士护卫。又册立他的两个儿子为王，食邑分别在犍为、广汉两郡的几个县。有人劝谏：“成败尚未可知，战士们风餐露宿，您却先封爱子为王，显得没有大志向！”公孙述不听，因此大臣们都心生怨恨。
（冯异入朝）： 冯异从长安到洛阳朝见。刘秀对公卿大臣说：“他是我起兵时的主簿，为我披荆斩棘，平定关中。”朝见结束后，赏赐冯异珍宝、钱帛，下诏说：“当年在仓促危难中，你在芜蒌亭献豆粥，在滹沱河献麦饭，你的深情厚谊，我久久未能报答。”冯异叩头拜谢说：“臣听说管仲对齐桓公说：‘愿君王不忘（我曾射中您带钩）的旧怨，臣不敢忘（您曾囚禁我于）槛车之恩。’齐国因此强盛。臣今天也希望陛下不忘在河北时的艰难，小臣不敢忘记陛下在巾车乡（赦免并重用我）的恩德。”冯异在洛阳逗留十多天，刘秀命他带着妻子儿女返回长安（关中）。
（人才任用）： 申屠刚、杜林从隗嚣处来到洛阳，刘秀都任命他们为侍御史。任命郑兴为太中大夫。
三月： 公孙述派田戎出江关（白帝城），招集旧部，想夺取荆州，未能成功。刘秀于是下诏给隗嚣，打算从天水方向讨伐蜀地（公孙述）。
（隗嚣拒绝）： 隗嚣上书说：“白水关险阻重重，栈道毁坏断绝。公孙述性情严酷，上下离心，应该等到他的罪恶充分暴露时再进攻，那时（讨伐他）就会形成一呼百应的态势。”刘秀知道隗嚣终究不会为自己所用，于是谋划讨伐他。
夏，四月，丙子（初八）： 刘秀亲临长安，拜谒西汉皇陵；派遣耿弇、盖延等七位将军取道陇地（今甘肃）讨伐蜀地（公孙述）。先派中郎将来歙带着盖有皇帝玺印的诏书去见隗嚣，传达旨意。
（来歙斥责隗嚣）： 隗嚣仍犹豫不决，反复设置疑虑。来歙非常气愤，当面斥责隗嚣：“朝廷认为您懂得善恶，明白兴衰，所以亲自写信表达诚意。您表示忠诚，已经派长子隗恂（伯春）入侍为质，现在反而听信奸佞迷惑的言论，准备招致灭族之祸吗？”说着就要上前刺杀隗嚣。隗嚣起身入内，部署士兵要杀来歙。来歙不慌不忙地拿着符节上车离去。隗嚣派牛邯率兵包围看守来歙。隗嚣的将领王遵劝谏：“来君叔（来歙字）虽然单车远来，但他是陛下的表兄（刘秀与来歙是表兄弟）。杀了他无损于汉朝，却会让我们立刻遭受灭族之灾。从前宋国扣押楚国使者，结果遭到围城，百姓交换孩子吃掉、劈尸骨当柴烧的灾祸。小国尚且不可侮辱，何况是拥有万乘兵车的天子？更何况您儿子伯春还在洛阳！”来歙为人讲信义，言行一致，他往来游说时的承诺，都可查证核实；西州的士大夫都信任敬重他，很多人替他说情，因此得以免难，东归洛阳。
五月，己未（二十一日）： 刘秀从长安回到洛阳。
（隗嚣反叛）： 隗嚣于是发兵反叛，派王元占据陇坻（陇山要隘），砍伐树木堵塞道路。汉军将领们因此与隗嚣交战，大败，各自率兵撤下陇山；隗嚣紧追不舍，马武挑选精锐骑兵断后，杀敌数千人，各路汉军才得以撤回。
六月辛卯（二十四日）： 刘秀下诏：“设置官吏，是为了百姓。如今百姓遭难，户口减少，而县级官吏职位设置仍很繁多。现命令司隶校尉、各州牧核实各自辖区，裁减吏员，县和封国不足以设置长吏（县令长等）的，予以合并。”于是合并裁减了四百多个县，吏职减损，十人中只留一人。
九月，丙寅晦（三十日）： 发生日食。执金吾（掌管京师治安）朱浮上书：“过去尧舜盛世，官员尚且要经过三次考核（才决定升降）；大汉兴起，也靠官员积累功劳政绩，官吏任职时间都很长，甚至长到子孙长大。那时的官吏职务，怎能都治理得好？议论的人，哪能不喧哗！大家都认为天地的功业不能仓促完成，艰难的事业需要日积月累。而近来地方长官频繁更换，迎新送旧，奔波于道路。考察他们任职时间很短，不足以充分显示其能力，朝廷又加以严厉督促，官吏人人不能自保，迫于被检举弹劾的压力，害怕被人讥刺，所以争相弄虚作假以求虚名浮誉，这正是导致日食月食等天象异常的原因。凡暴长的事物必定夭折，仓促成功的事业必定迅速败坏。如果摧残长久的事业而追求速成的功绩，这不是陛下的福分。愿陛下放眼数年之后，寄望于一代人之后的太平盛世，天下就太幸运了！”刘秀采纳了他的意见，从此地方长官更换比较简省。
十二月，壬辰（二十七日）： 大司空宋弘被免职。
癸巳（二十八日）： 刘秀下诏：“前些时候战事未停，国家用度不足，所以实行十分抽一的田税。如今粮食储备略有积存，现命令各郡国恢复收取现有田地三十分之一的田税，依照旧制（西汉旧制）。”
（后续战事与治理）：
汉军将领们从陇山败退时，刘秀下诏命耿弇驻军漆县，冯异驻军栒邑，祭遵驻军汧县，吴汉等返回长安驻守。冯异率军尚未到达栒邑，隗嚣乘胜派王元、行巡率领二万多人下陇山，分派行巡夺取栒邑。冯异立刻急行军想抢先占据栒邑。将领们说：“敌兵强大且乘胜而来，不可与其争锋，应当停止进军，在有利地形扎营，慢慢想对策。”冯异说：“敌兵压境，惯于争夺小利，就想深入；如果他们占领栒邑，三辅地区就会动摇。进攻力量不足，防守则力量有余。现在我们先占据城池，以逸待劳，不是去和他们争锋。”于是秘密快速赶到栒邑，关闭城门，偃旗息鼓。行巡不知情，驱车疾进。冯异乘其不备，突然擂鼓竖旗杀出。行巡军惊慌失措，四散奔逃，汉军追击，大败敌军。祭遵也在汧县击败王元。于是北地郡（今甘肃庆阳一带）的豪强首领耿定等人全都背叛隗嚣投降。刘秀下诏命冯异进军义渠，击败卢芳的将领贾览和匈奴奥鞬日逐王（奥鞬是匈奴王号），北地郡、上郡、安定郡（今陕甘宁交界一带）全部投降。
（窦融表忠心）： 窦融又派弟弟窦友上书：“臣有幸能托身于先皇后（刘秀的姑母刘黄，嫁窦融从弟窦友之父）的亲属之列，世代担任二千石高官。臣又暂代将帅之职，镇守一方，所以派遣刘钧口头陈述肝胆忠心，自以为内心表露无遗，毫无隐瞒。然而陛下的诏书却极力称说蜀、汉二主（公孙述、隗嚣）三分鼎足之权，任嚣、尉佗（割据自立）的计谋，臣私下深感痛心。臣窦融虽然无知，也还懂得利害的关键、顺逆的区分。岂能背叛真正正统的旧主（指刘秀），去事奉奸伪之人；废弃忠贞的节操，去做颠覆朝廷的事；抛弃已成的基业，去追求无望的利益。这三条，即使问一个狂人，也知道该如何选择，何况是臣！谨派弟弟窦友到朝廷，当面陈述至诚之心。”窦友到达高平（今宁夏固原），正遇隗嚣反叛，道路不通，于是派司马席封抄小路送信到洛阳。刘秀再派席封带信给窦融、窦友，给予深切安慰。窦融于是写信给隗嚣：“将军在遭遇厄运、国家（指更始政权）不利之时，仍能坚守节操，效忠本朝（指刘秀）。我们之所以心悦诚服于您的高义，愿意追随您效力，正是因为这一点！然而您因一时愤懑，改变节操，另作图谋，放弃成功的道路，走向艰难失败的境地，百年的功业，毁于一旦，岂不可惜！恐怕是您左右的人贪功献计，才至于此。如今西州地势局促狭窄，军民离散，易于帮助别人，难以独立建业。如果计谋失误，迷途不返，那么您不南合公孙述（子阳），就只有北投卢芳（文伯）了。倚仗虚假的交情而轻视强大的对手，依靠远方的救援而看轻近处的敌人，看不到有什么好处。自战乱以来，城郭化为废墟，百姓辗转死于沟壑。幸赖上天运转，局势稍定，而将军却重新陷入危难，这将使积重难返的痼疾无法痊愈，幼小的孤儿将再度流离失所，说起来就让人鼻酸。平庸的人尚且不忍心，何况是仁者呢！我听说效忠不难，但做得恰当实在不易。替人忧虑过深，反而以德招怨，我知道自己会因这些话而获罪了！”隗嚣不听劝告。窦融于是与五郡太守共同整顿兵马，上疏请示出师日期；刘秀深表嘉许赞美。窦融随即与各郡太守率兵进入金城（今甘肃兰州），攻击隗嚣的党羽先零羌首领封何等，大败他们。接着沿黄河布阵，展示军威，等待刘秀车驾到来。当时大军尚未进发，窦融便率军返回。刘秀因窦融讲信义、效忠的诚意显着，更加嘉许他，下令整修窦融父亲的坟墓，用太牢（牛猪羊三牲）祭祀，并多次派遣轻装使者，送去各地珍贵的食物。梁统（窦融部将）仍然担心大家心存疑惑，就派人刺杀了（隗嚣派来的说客）张玄，于是与隗嚣彻底断绝关系，解下了隗嚣授予的所有将军印绶。
世祖光武皇帝中之上 建武七年（辛卯年，公元31年）
春，三月： 刘秀下诏撤销各郡、各封国的轻车、骑士、材官（地方预备役兵种），命他们全部复员为民。
（隗嚣受封）： 公孙述册立隗嚣为朔宁王，派兵往来，为他声援。
癸亥晦（三月三十日）： 发生日食。刘秀下诏命百官各自呈上密封奏章（上书者不得称自己为“圣”）。太中大夫郑兴上疏：“国家没有善政，上天就用日食月食来谴责。关键在于顺应人心，选贤任能。如今公卿大夫多推举渔阳太守郭汲可任大司空，却不及时决定；外面传言纷纷，都说‘朝廷打算任用功臣’。任用功臣就会使官职与人才错位。愿陛下委屈自己顺从众议，以成全群臣推让贤能的美德。近年日食常在月末，比正常时间提前，都是月亮运行速度加快所致。太阳象征君主，月亮象征臣子；君主急切则臣下紧迫，所以月亮运行加速。如今陛下高明而群臣惶惧不安，应当留心用宽和克制的办法施政，留意《洪范》所说的为政之道。”刘秀处理政事勤勉，但有时失于严苛急迫，所以郑兴的奏章提到这一点。
夏，四月，壬午（十九日）： 刘秀下诏大赦天下。
五月，戊戌（初六）： 任命前将军李通为大司空。
（监督三公争议）： 大司农江冯建议：“应命司隶校尉督察三公（太尉、司徒、司空）。”司空掾（司空属官）陈元上书：“臣听说以臣为师者为帝，以臣为宾者为霸。所以周武王以太公为师，齐桓公以管仲为仲父。近世则有高祖优待相国（萧何）的礼仪，文帝（太宗）赋予宰辅（陈平、周勃）的权力。到了新朝王莽，乘汉朝中衰，独揽国家大权以窃取天下，他把自己比作周公，不信任群臣，剥夺三公职权，降低宰相威严，以揭发隐私为明察，以攻击过失为正直，以至于奴仆告发主人，儿子、弟弟告发父亲、兄长，法网严密，刑罚峻急，大臣们手足无措；然而他仍不能禁止董忠（王莽时卫将军，后谋反被杀）的阴谋，自己最终被世人杀戮。现在四方尚未安定，天下还未统一，百姓都在观望倾听，耳目专注。陛下应学习周文王、武王的圣明典章，承袭祖先的遗德，礼贤下士，放下架子优待贤才，实在不应该让有关部门去监察三公的名声。”刘秀采纳了他的意见。
（凉州人事）： 酒泉太守竺曾因弟弟报仇杀人，自己辞去太守职务；窦融以朝廷名义任命竺曾为武锋将军，改派辛肜为酒泉太守。
秋： 隗嚣率领步骑兵三万侵犯安定郡（治今甘肃镇原），到达阴盘（今陕西长武西北），冯异率诸将阻击；隗嚣又派另一将领下陇山攻打在汧县的祭遵。两路都失利而回。刘秀准备亲自征讨隗嚣，先通知窦融出兵日期，正遇大雨，道路断绝，而且隗嚣的军队已撤退，才作罢。刘秀命令来歙写信招降王遵（隗嚣部将），王遵前来投降，被任命为太中大夫，封向义侯。
冬： 卢芳因事诛杀了他的五原太守李兴兄弟。他的朔方太守田飒、云中太守乔扈各自献出郡城投降。刘秀命他们仍担任原职。
（刘秀与郑兴议谶）： 刘秀喜好图谶（预言书），与郑兴商议到郊外祭祀天地之事，说：“我想用图谶来推断，怎么样？”郑兴回答：“臣不研究图谶。”刘秀怒道：“你不研究图谶，是认为它不对吗？”郑兴惶恐地说：“臣只是对书中某些内容未曾学习，并没有认为它不对。”刘秀的怒气才消。
（杜诗治南阳）： 南阳太守杜诗治理政务清廉公正，兴利除害，百姓生活便利。又兴修水利，广拓田地，郡内家家富足，当时人们把他比作西汉时的好官召信臣。南阳人流传着这样的歌谣：“前有召父（召信臣），后有杜母（杜诗）。”
世祖光武皇帝中之上 建武八年（壬辰年，公元32年）
春： 来歙率领二千多人劈山开路，从番须、回中（今陕西陇县西北）直袭略阳（今甘肃秦安东北），斩杀隗嚣守将金梁。隗嚣大惊：“怎么如此神速！”刘秀听说攻占了略阳，非常高兴，说：“略阳是隗嚣依仗的屏障。心腹（要害）已被击破，那么制服他的肢体（其余部分）就容易了！”吴汉等将领听说来歙占据了略阳，争相驱马奔赴。刘秀认为隗嚣失去了所倚仗的屏障，丢掉了重要城池，势必出动所有精锐部队来进攻；等到旷日持久围城不下，士兵疲惫不堪，汉军再乘危进攻，于是下令追回吴汉等人。隗嚣果然派王元据守陇坻，行巡据守番须口，王孟阻塞鸡头道（今宁夏隆德东），牛邯驻军瓦亭（今宁夏固原南）。隗嚣亲自率领全部主力数万人包围略阳。公孙述派将领李育、田弇助战。他们劈山筑堤，蓄水灌城。来歙与将士们誓死坚守，箭用光了，就拆房屋砍树木当兵器。隗嚣用尽精锐攻城，一连几个月也没能攻下。
夏，闰四月： 刘秀准备亲自率军征讨隗嚣。光禄勋汝南人郭宪劝阻：“东方刚刚平定，陛下不可远征。”并挡住车驾，拔出佩刀砍断牵引车驾的皮带（靷）。刘秀不听，西行至漆县（今陕西彬县）。将领们大多认为皇帝率领的军队重要，不宜深入险地，计划犹豫未决；刘秀召见马援询问。马援于是分析说隗嚣的将帅有土崩瓦解的趋势，汉军进兵必能击破敌军；又在刘秀面前用米堆成山谷模型，指点山川形势，指明各路大军应走的道路，分析得清楚透彻。刘秀说：“敌人全在我眼中了！”第二天一早，就进军，抵达高平县第一城（今宁夏固原）。窦融率领五郡太守及羌人、小月氏等步骑兵数万人，辎重车五千多辆，与刘秀大军会合。当时军队初创，诸将朝见皇帝的礼仪多不整肃。窦融先派从事（属官）询问朝见皇帝的适当礼仪。刘秀听说后认为很好，就向百官宣告，于是设置盛大的酒宴，用特殊的礼仪接待窦融等人。然后共同进军，分几路挺进陇山。派王遵写信招降牛邯，牛邯投降，被任命为太中大夫。于是隗嚣的大将十三人、所属十六个县、部众十余万人全部投降。隗嚣带着妻子儿女逃奔西城（今甘肃天水西南），投奔杨广，而田弇、李育退守上邽（今甘肃天水）。略阳之围解除。刘秀慰劳赏赐来歙，让他单独坐一席，座位在诸将之上，赏赐来歙妻子绢帛一千匹。刘秀进军到达上邽，下诏告谕隗嚣：“你如果自己捆着双手来投降，可保你们父子相见，绝无意外。如果你决心要做黥布（指顽抗到底），也由你自己决定。”隗嚣始终不肯投降，于是刘秀下令处死他的儿子隗恂。派吴汉、岑彭包围西城，耿弇、盖延包围上邽。将四个县封给窦融为安丰侯，封其弟窦友为显亲侯，五郡太守也都封为列侯，命他们西行返回各自驻守的郡。窦融因长期在地方专权，内心不安，多次上书请求派人接替。刘秀下诏答复：“我与将军就像左右手一样，你几次上书谦让辞职，怎么不明白我的心意呢！你要努力安抚士民，不要擅自离开你的部属！”
（颍川叛乱）： 颍川郡盗贼蜂起，攻陷属县。河东郡的驻军也叛变，京师洛阳震动。刘秀听说后说：“我后悔没听郭子横（郭宪）的劝告。”
（陇蜀之叹）： 秋，八月： 刘秀从上邽日夜兼程东返，写信给岑彭等人：“如果攻下西城、上邽两城，便可率军南下进攻蜀虏（公孙述）。人苦于不知足啊，既平定了陇地（今甘肃），又望着蜀地（今四川）。每一次发兵，头发胡须都因此变白！”
（平定颍川）： 九月，乙卯（九月乙卯日）： 刘秀回到洛阳。他对执金吾寇恂说：“颍川迫近洛阳，应当及时平定。我思来想去只有你能平定它，你从九卿之位再次出任地方官，为国分忧吧！”寇恂回答：“颍川人听说陛下正忙于陇、蜀战事，所以狂妄狡猾之徒乘机作乱，互相牵连。如果听说陛下御驾亲征，贼寇必定惶恐归降，臣愿充当先锋。”刘秀同意。庚申（九月庚申日）： 刘秀南征，颍川盗贼全部投降。寇恂最终没有被任命为太守，百姓拦住道路说：“恳请陛下再借寇君（寇恂）给我们一年。”于是刘秀把寇恂留在长社（今河南长葛东），镇抚官吏百姓，接纳余下投降的贼寇。东郡、济阴也有盗贼起事，刘秀派李通、王常进攻。因东光侯耿纯曾当过东郡太守，在卫地（东郡古属卫国）威信卓着，刘秀派使者任命他为太中大夫，让他与大军会合于东郡。东郡人听说耿纯进入郡界，九千多名盗贼都向耿纯投降，大军不战而还；刘秀再次任命耿纯为东郡太守。戊寅（九月戊寅日）： 刘秀从颍川返回洛阳。
（张步之死）： 安丘侯张步带着妻子儿女逃奔临淮，与弟弟张弘、张蓝想招集旧部，乘船入海。琅邪太守陈俊追击讨伐，斩杀张步。
冬，十月，丙午（十月丙午日）： 刘秀前往怀县（今河南武陟西南）；十一月，乙丑（十一月乙丑日）： 返回洛阳。
（西城之战）： 杨广（隗嚣将领）死去，隗嚣处境困窘。他的大将王捷另在戎丘（今甘肃天水附近）驻守，登上城楼向汉军呼喊：“为隗王守城的人，都抱必死决心，绝无二心。请你们赶快停止攻城，我用自杀来表明心迹！”于是自刎而死。
（汉军失利撤军）： 当初，刘秀告诫吴汉：“各郡来的士兵（指地方军）只是白白消耗粮食，如果有人逃亡，就会动摇军心，应该全部遣散。”吴汉等人贪图人多合力进攻隗嚣，就没有遣散，粮食日渐减少，官兵疲惫，逃亡的人很多。岑彭堵塞谷水（今葫芦河）灌西城，水位离城墙顶部只差一丈多。恰遇王元、行巡、周宗率领公孙述派来的五千多蜀地救兵，从高处突然赶到，战鼓齐鸣，大声呼喊：“百万大军来了！”汉军大惊，还没来得及布阵，王元等冲破包围，殊死战斗，于是得以进入西城，迎接隗嚣回到冀县（今甘肃甘谷东）。吴汉军队粮食耗尽，就焚烧辎重，率军下陇山撤退。盖延、耿弇也相继撤退。隗嚣出兵尾随攻击各营。岑彭率军断后，诸将才得以全军东归；只有祭遵仍驻屯汧县没有撤退。吴汉等又驻屯长安，岑彭返回津乡（今湖北江陵）。于是安定、北地、天水、陇西等郡重新反叛归附隗嚣。
（温序死节）： 校尉、太原人温序被隗嚣将领苟宇俘获，苟宇再三晓谕劝降。温序大怒，呵斥苟宇等人：“你们这些贼虏怎么敢胁迫汉将！”随即用手中符节击杀数人。苟宇部众争着要杀温序，苟宇制止说：“这是位义士，为气节而死，可以赐给他一把剑。”温序接过剑，把胡须衔入口中，对左右说：“既然被贼寇所杀，别让胡须被土玷污了！”于是伏剑自刎。从事王忠护送他的遗体回洛阳，刘秀下诏赐给他墓地，任命他的三个儿子为郎官。
十二月： 高句丽王派使者朝贡，刘秀恢复了他的王号。
这一年： 发生大水灾。
世祖光武皇帝中之上 建武九年（癸巳年，公元33年）
春，正月： 颍阳成侯祭遵在军中去世。刘秀下诏命冯异兼管祭遵的军营。祭遵为人廉洁节俭，小心谨慎，克己奉公，所得赏赐都分给士卒；部队纪律严明，所到之处秋毫无犯，官吏百姓都不知道有军队驻扎。他选拔人才都用儒家标准，饮酒作乐时，一定演奏雅乐（如《诗经》配乐）、玩投壶游戏。临终时，嘱咐薄葬；问及家事，始终一言不发。刘秀对他的去世异常哀痛。祭遵的灵柩运回河南（郡），刘秀穿着丧服亲临吊丧，望着灵车痛哭；回宫时，经过洛阳城门，看到灵车经过，又痛哭不止；丧礼完成后，又亲自以太牢之礼祭祀。下诏命大长秋（皇后宫官）、谒者（礼官）、河南尹（地方官）共同主持丧事，大司农负责费用。到安葬时，刘秀又亲临；安葬后，又到他的坟前，接见祭遵的夫人和家属。后来朝会时，刘秀每每叹息：“哪里还能找到像祭征虏（祭遵曾任征虏将军）那样忧国奉公的人啊！”卫尉铫期说：“陛下极其仁慈，哀念祭遵不已，使群臣各自心怀惭愧恐惧。”刘秀才不再叹息。
（隗嚣病死）： 隗嚣又病又饿，只能吃干粮（糗r），最终愤恨而死。王元、周宗拥立隗嚣的小儿子隗纯为王，统领军队据守冀县（今甘肃甘谷东）。公孙述派将领赵匡、田弇援助隗纯。刘秀派冯异率军进攻。
（公孙述据荆门）： 公孙述派翼江王田戎、大司徒任满、南郡太守程泛率领数万人顺长江而下，出江关（白帝城），击败冯骏等军，于是攻占巫县及夷道、夷陵，随后占据荆门山、虎牙山（均在今湖北宜昌附近）。他们在长江上架起浮桥、修建关楼，把大木柱（赞柱）竖立江中以阻断航道，结营扎寨跨山连接以阻塞陆路，抗拒汉军。
夏，六月，丙戌（初六）： 刘秀驾临缑氏（今河南偃师东南），登上轘辕山（今河南偃师东南）。
（防御匈奴）： 吴汉率领王常等四位将军的五万多士兵，在高柳（今山西阳高）进攻卢芳的将领贾览、闵堪；匈奴派兵救援，汉军失利。于是匈奴势力转盛，抢掠日益加剧。刘秀下诏命朱祜驻屯常山郡（治今河北元氏西北），王常驻屯涿郡（治今河北涿州），破奸将军侯进驻屯渔阳郡（治今北京密云西南），任命讨虏将军王霸为上谷郡（治今河北怀来东南）太守，以防备匈奴。
（来歙经营凉州）： 刘秀派来歙统管驻守长安的所有将领，太中大夫马援做他的副手。来歙上书：“公孙述以陇西、天水二郡作为屏障，所以才能苟延残喘；如今二郡已被扫平，公孙述的智谋就穷尽了。我们应增选兵马，储备物资。现在西州（陇右）刚受重创，军民疲惫饥饿，如果用财货粮食招引，那么他的部众可以聚集。臣知道国家需要供给的地方不止一处，财政困难，但这样做是不得已的！”刘秀认为有理。于是下诏在汧县（今陕西陇县南）储备粮食六万斛。
秋，八月： 来歙率领冯异等五位将军在天水郡讨伐隗纯。
（杜茂失利）： 骠骑将军杜茂在繁畤（今山西浑源西南）与贾览交战，杜茂军大败。
（安置羌人）： 羌族各部落从王莽末年迁入边塞，金城郡（治今甘肃兰州西）所属各县多被他们占据。隗嚣无力征讨，趁机安抚接纳，征发羌人部众与汉朝对抗。司徒掾班彪上书：“现在凉州各郡都有归降的羌人。羌人披散头发，衣襟向左开（披发左衽），与汉人杂居一起，习俗不同，言语不通，常常被小官吏和狡猾之人侵夺，穷困怨恨，无处申诉，所以导致反叛。蛮夷寇乱，都是因为这个缘故。旧制规定，益州（今四川）设置蛮夷骑都尉，幽州（今河北北部、辽宁）设置领乌桓校尉，凉州设置护羌校尉，都持符节统领保护（羌胡），处理他们的纠纷，每年定时巡行，询问疾苦。又多次派遣使者翻译，沟通情况，让塞外的羌族部落成为朝廷的耳目，州郡因此可以警戒防备。现在应当恢复旧制，以显示威严，加强防备。”刘秀采纳。任命牛邯为护羌校尉。
（阴氏之祸）： 盗贼杀害了贵人阴丽华（光武帝皇后）的母亲邓氏和弟弟阴。刘秀非常悲伤，封阴贵人的弟弟阴就为宣恩侯。又召见阴就的哥哥侍中阴兴，打算封他，把印绶放在他面前。阴兴坚决推辞：“臣没有冲锋陷阵的功劳，而一家数人，都蒙恩受封爵位采邑，令天下人失望，这实在是臣所不愿的！”刘秀嘉许他的志节，没有强迫他。阴贵人问他原因，阴兴说：“外戚之家苦于不知谦退，嫁女儿总想配侯王，娶媳妇就盯着公主，我心里实在不安。富贵有极限，人应当知足，夸耀奢侈只会更被舆论讥笑。”阴贵人被他的话感动，深自谦抑，始终不替宗亲求取官位。
（郭汲治颍川）： 刘秀召回寇恂，任命渔阳太守郭汲为颍川太守。郭汲招降山贼赵宏、召吴等数百人，都遣送回乡务农；他因此弹劾自己擅自做主，刘秀没有责备他。后来赵宏、召吴的党羽听说郭汲的威信，远自江南，或从幽州、冀州，不约而同前来投降，络绎不绝。
（莎车易主）： 莎车王康去世，弟弟贤继位，攻打并杀死拘弥王、西夜王，而让康的两个儿子分别当拘弥王和西夜王。
世祖光武皇帝中之上 建武十年（甲午年，公元34年）
春，正月： 吴汉再次率领捕虏将军王霸等四位将军、六万士兵，从高柳（今山西阳高）出击贾览，匈奴数千骑兵救援贾览。双方在平城（今山西大同东北）城下接连交战，汉军击溃敌军，将其赶跑。
（平定隗纯）： 夏： 夏阳节侯冯异等人与赵匡、田弇交战将近一年，终于将他们斩杀。隗纯尚未攻下，将领们想暂且休兵，冯异坚持不动摇，共同进攻落门（今甘肃武山东北），未能攻克。夏： 冯异在军中去世。
秋，八月，己亥（八月己亥日）： 刘秀到达长安。
（降服高峻）： 当初，隗嚣的将领、安定人高峻拥兵据守高平县第一城（今宁夏固原）。建威大将军耿弇等包围该城，一年未能攻下。刘秀准备亲自征讨，寇恂劝阻：“长安处在中心位置，接应各方最为便捷，陛下坐镇于此，安定、陇西之敌必定心怀震惧；这样从容控制一处，可以制服四方。如今士兵战马疲惫，正要经历险阻，对陛下万乘之尊来说不够安全。前年颍川（叛乱）的教训，可作为最深刻的警戒。”刘秀不听，戊戌（八月戊戌日）： 进军抵达汧县（今陕西陇县南）。高峻仍不投降，刘秀派寇恂前往劝降。寇恂带着盖有皇帝玺印的诏书到达第一城，高峻派军师皇甫文出城拜见。皇甫文言辞礼节毫不屈服，寇恂大怒，要杀他。将领们劝阻：“高峻精兵万人，多持强弩，封锁陇道，连年攻不下。现在要招降他却杀他的使者，恐怕不行吧？”寇恂不答应，于是斩了皇甫文，放他的副使回去告诉高峻：“军师无礼，已被杀了！要投降，赶快投降；不想投降，就坚守！”高峻惶恐不安，当天就打开城门投降。将领们都来祝贺，趁机问：“请问杀了他的使者却能使他献城投降，为什么呢？”寇恂说：“皇甫文是高峻的心腹，是他的智囊。这次来，言辞态度不屈服，必定没有投降的意思。放他回去，皇甫文得以施展计谋；杀了他，高峻就吓破了胆，所以投降。”将领们都说：“这我们想不到啊！”
冬，十月： 来歙与将领们攻破落门（今甘肃武山东北），周宗、行巡、苟宇、赵恢等带着隗纯投降。王元逃奔蜀地（公孙述）。刘秀把隗氏家族迁徙到京城以东。后来隗纯与宾客逃往胡地（匈奴），到了武威郡（治今甘肃武威），被捕获处死。
（平定羌乱）： 先零羌与其他羌人部落几万人，屯聚抢掠，据守浩亹隘（今甘肃永登西南大通河畔）。来歙率领盖延等进击，大破羌军，斩杀俘虏数千人。于是打开粮仓赈济饥民，陇右（今甘肃东部）于是安定，凉州（今甘肃、宁夏）的道路也畅通了。
庚寅（十月庚寅日）： 刘秀返回洛阳。
世祖光武皇帝中之上 建武十一年（乙未年，公元35年）
春，三月，己酉（三月己酉日）： 刘秀驾临南阳（郡治今河南南阳），又到章陵（今湖北枣阳南）；庚午（三月庚午日）： 返回洛阳。
（荆门之战）： 岑彭驻屯津乡（今湖北江陵），多次进攻田戎等人，未能取胜。刘秀派吴汉率领诛虏将军刘隆等三位将领，征调荆州兵共六万余人、骑兵五千，在荆门（今湖北宜昌东南）与岑彭会合。岑彭装备战船数十艘，吴汉认为各郡水兵（棹卒）耗费粮食太多，想遣散他们。岑彭认为蜀军兵力强盛，不能遣散水兵，上书说明情况。刘秀回复岑彭：“大司马（吴汉）习惯使用步兵骑兵，不懂水战，荆门战事，全由征南公（岑彭时任征南大将军）主持。”闰月： 岑彭在军中招募攻击浮桥的勇士，先登上浮桥的给予最高奖赏。偏将军鲁奇应募出战。当时东风猛烈，鲁奇的船逆流而上，直冲浮桥。但桥柱上装有带钩的倒杷（反杷钩），钩住鲁奇的船，无法离开。鲁奇等人乘势拼死战斗，并投掷火把焚烧浮桥。风大火猛，桥楼崩塌燃烧。岑彭率领全军顺风并进，所向无敌。蜀兵大乱，淹死数千人。汉军斩杀任满，活捉程泛，田戎逃走退保江州（今重庆）。岑彭上奏推荐刘隆为南郡太守；自己率领辅威将军臧宫、骁骑将军刘歆长驱直入江关（白帝城）。严令军中不得掳掠，所过之处，百姓都奉献牛肉美酒迎接慰劳。岑彭一再推辞不接受。百姓非常高兴，争相打开城门投降。刘秀下诏任命岑彭代理益州牧；所攻下的郡，就由岑彭兼行太守事。岑彭如果离开某郡，就把太守的官号交给后任将军。挑选官吏担任州中长官。岑彭抵达江州，因该城坚固，粮食充足，难以迅速攻下，就留冯骏看守；自己率军乘胜直指垫江（今重庆合川），攻破平曲（今合川东），缴获米粮数十万石。吴汉留在夷陵（今湖北宜昌），乘坐只有桨露在外面的战船（露桡船）继续前进。
夏： 先零羌侵犯临洮（今甘肃岷县）。来歙推荐马援为陇西太守。马援率军进击先零羌，大败羌军。
（来歙遇刺）： 公孙述任命王元为将军，命他与领军环安在河池（今甘肃徽县西北）抵御汉军。六月： 来歙与盖延等进攻王元、环安，大败蜀军，于是攻克下辨（今甘肃成县西北），乘胜继续进军。蜀人非常恐惧，派刺客行刺来歙。来歙未死，派人紧急召见盖延。盖延见到来歙，伏地悲痛，不敢抬头仰视。来歙斥责盖延：“虎牙将军（盖延曾任虎牙大将军）怎么敢这样！现在我作为使者被刺客所伤，无法报效国家，所以叫你来，想把军事托付给你，你反而像小孩子一样哭哭啼啼吗！刀虽然还插在我身上，难道我就不能下令杀了你吗？”盖延擦干眼泪勉强起身，接受嘱托。来歙亲手书写奏章：“臣在深夜人静之后，被不知何人行刺，伤中要害。臣不敢顾惜自己，深恨奉职无状，给朝廷带来羞辱。治国以得到贤才为根本，太中大夫段襄，刚直忠贞，可以重用，愿陛下裁决明察。另外臣的兄弟不贤，最终恐怕会获罪，请陛下哀怜，时常加以教诲监督。”写罢，扔掉笔，拔出凶器（匕首），气绝身亡。刘秀听说后，极为震惊，一面看奏章，一面流泪。任命扬武将军马成代理中郎将，接替来歙。来歙的灵柩运回洛阳，刘秀乘车，身穿丧服，亲自吊丧、送葬。
（二鲍刚直）： 赵王刘良跟随刘秀为来歙送葬返回，进入夏城门（洛阳城门之一），与中郎将张邯争道，呵斥张邯掉转车头，又责问守卫城门的门候，让他向前走了几十步。司隶校尉鲍永弹劾：“刘良不守藩臣礼节，犯大不敬之罪。”刘良是尊贵显要的皇族，鲍永弹劾他，朝廷为之肃然。鲍永征召扶风人鲍恢担任都官从事（监察官），鲍恢也刚正不屈，不畏权贵。刘秀常说：“皇亲贵戚暂且收敛，以避开二鲍（鲍永、鲍恢）。”鲍永巡视属县到霸陵（今陕西西安东北），途经更始帝刘玄的坟墓，下拜哭泣，尽哀而去。向西到达扶风郡，杀牛祭奠苟谏（鲍永父亲鲍宣的门生，曾救鲍永）的坟墓。刘秀听说后，心中不满，问公卿大臣：“奉使命出巡而做这样的事（指祭拜更始墓），怎么样？”太中大夫张湛回答：“仁，是行为的宗旨；忠，是道德的主干。仁者不忘旧主，忠者不忘君主，这是品行高尚的表现。”刘秀才释然。
（刘秀亲征）： 秋，七月： 刘秀亲自率军征讨公孙述，驻军长安。
（平定巴蜀）： 公孙述派将领延岑、吕鲔、王元、公孙恢出动全部兵力在广汉（今四川射洪南）和资中（今四川资阳）布防；又派将领侯丹率领二万余人据守黄石（今四川涪陵东北）。岑彭命臧宫率领归降士兵五万人，沿涪水（今嘉陵江支流涪江）而上到平曲（今四川合川东），牵制延岑；自己分兵乘船顺长江而下返回江州（今重庆），再溯都江（今岷江）而上，袭击侯丹，大败侯丹军。接着日夜兼程，急行二千余里，径直攻陷武阳（今四川彭山东）。派出精锐骑兵飞驰袭击广都（今四川双流东南），离成都仅数十里，攻势如暴风骤雨，所到之处，蜀军全都溃散奔逃。起初，公孙述听说汉军在平曲，所以派出大军迎击。等到岑彭抵达武阳，绕到延岑军的背后，蜀地举国震骇。公孙述大惊，用杖击地说：“怎么这样神速！”延岑在沅水（今四川绵阳境）集结重兵。臧宫兵多粮少，运输跟不上，投降的士兵都想叛逃，回到当地郡县，重新聚众观望成败。臧宫想率军撤退，又怕部下反叛；恰遇刘秀派谒者（使者）带兵到岑彭那里，有马七百匹，臧宫假托圣旨全部留下充实自己部队。日夜进军，多树旗帜，登山擂鼓呐喊；右边是步兵，左边是骑兵，护卫着战船前进，呼喊声震动山谷。延岑没料到汉军突然到来，登山了望，极度震恐；臧宫趁机纵兵攻击，大败延岑，斩杀、淹死蜀军一万多人，江水都变浑浊了。延岑逃奔成都，他的军队全部投降，汉军缴获了他的全部兵马珍宝。随后汉军乘胜追击，投降的蜀军数以十万计。大军到达平阳乡（今四川三台境），王元率部众投降。刘秀写信给公孙述，陈述祸福，表明自己的信义。公孙述看信叹息，拿给亲信传看。太常常少、光禄勋张隆都劝公孙述投降。公孙述说：“兴衰是命运，哪里会有投降的天子呢！”左右侍从没人敢再说话。常少、张隆都因忧虑去世。
（岑彭遇刺）： 冬，十月： 公孙述派刺客假装是逃亡的奴仆，投降岑彭，在夜间刺杀了岑彭。太中大夫、监军郑兴接管了他的部队，等待吴汉到来后移交。岑彭治军严整，秋毫无犯。邛谷王任贵（西南夷首领）仰慕岑彭的威望信誉，从几千里外派使者来投降；正逢岑彭已被害，刘秀就把任贵所献的礼物全部赐予岑彭的妻子儿女。蜀人为岑彭建庙祭祀。
（平定武都）： 马成等攻破河池，于是平定武都郡（治今甘肃西和西南）。先零羌及其他羌人部落几万人，屯聚抢掠，据守浩亹隘（今甘肃永登西南）。马成与马援深入讨伐，大败羌人，将投降的羌人迁徙安置在天水、陇西、扶风三郡。
（马援谏弃地）： 这时，朝臣认为金城郡破羌县（今青海乐都东）以西，路途遥远，盗贼众多，提议放弃该地。马援上书：“破羌县以西，城池大多完好坚固，易于固守。那里土地肥沃，灌溉便利。如果让羌人占据湟中地区（今青海湟水流域），就会为害不止，不可放弃。”刘秀同意。于是归来的百姓有三千多人。马援为他们设置地方官吏，修缮城郭，建筑了望堡垒，开凿沟渠，鼓励耕田放牧，郡中人民安居乐业。马援又招抚塞外的氐人、羌人，使他们全部归降依附。马援奏请恢复他们侯王君长的称号，刘秀全都批准。于是撤销马成的部队。
十二月： 吴汉从夷陵（今湖北宜昌）率领三万人，沿长江逆流而上，讨伐公孙述。
（郭汲建言）： 郭汲担任并州牧（刺史），经过京城洛阳，刘秀问他为政得失。郭汲说：“选拔补充各级官吏，应当从全国选拔贤能俊杰，不应专用南阳郡（刘秀故乡）人。”当时担任官职的多是刘秀的同乡或故旧，所以郭汲提到这一点。