炎龙独立军、八路军和国民党军队达成初步合作意向后，各方都积极投入到合作的筹备工作中。然而，如同平静湖面下隐藏着暗礁，在合作初期，各种问题和矛盾逐渐浮现，给这来之不易的合作带来了挑战。
尽管三方都有着抗日的共同目标，但由于各自的发展历程、作战理念不同，在合作细节上产生了诸多分歧。
八路军长期在敌后开展游击战争，强调发动群众，依靠人民力量，以灵活多变的战术消耗敌人。他们习惯在战斗中因势利导，根据实际情况迅速调整作战计划。而国民党军队遵循传统的正规战模式，注重阵地防御和大规模兵团作战，作战计划相对刻板，强调层级指挥和严格的军令执行。炎龙独立军则凭借先进的装备和独特的训练体系，擅长执行一些具有创新性和高难度的特种作战任务，作战风格勇猛且灵活。
在一次关于作战计划的讨论会议上，这种理念差异表现得淋漓尽致。针对日军在某地区的一处重要据点，八路军代表提议：“我们可以发动当地群众，对据点周边的道路进行破坏，同时组织小规模的游击队伍对据点进行骚扰，待日军疲惫不堪、防御出现漏洞时，再集中力量一举攻克。”国民党军队指挥官却对此不以为然，反驳道：“这种打法过于拖沓，我们应该集中优势兵力和火力，正面强攻，迅速拿下据点，以免夜长梦多。”炎龙独立军代表则提出：“我们可以利用特种部队渗透到据点内部，配合外部的佯攻，里应外合，以最小的代价夺取据点。”三方各执一词，谁也无法说服谁，会议陷入了僵局。
这种理念上的差异不仅体现在作战计划上，还反映在部队管理和群众工作方面。八路军注重与群众建立紧密联系，部队纪律严明，与百姓亲如一家。而国民党军队在一些地方，由于部分官兵纪律松散，与群众关系较为紧张。炎龙独立军虽然也重视群众支持，但因其作战方式的特殊性，与群众的互动方式又有所不同。这些差异导致在合作区域的群众工作开展上，各方难以形成统一的模式，影响了合作的效果。
随着合作的推进，资源分配问题也逐渐凸显出来。在武器装备、物资补给以及作战区域划分等方面，三方出现了利益纠葛。
武器装备方面，炎龙独立军拥有系统提供的先进装备，但数量有限。八路军由于长期在艰苦的敌后作战，武器装备相对落后，急需提升。国民党军队虽然整体装备优于八路军，但部分嫡系部队与非嫡系部队之间装备差距较大。当炎龙独立军提出将部分装备技术分享给八路军时，国民党军队内部一些人表示不满，认为应该优先满足国民党军队的需求。他们担心八路军装备提升后，会影响国民党在战后的政治地位。这种内部的利益纷争，使得装备技术的分享工作受到阻碍。
物资补给上，合作区域内的物资储备有限。国民党军队凭借其相对完善的补给体系，在物资分配上占据优势。八路军和炎龙独立军在物资获取上相对困难。尤其是在一些偏远的合作区域，物资运输不便，国民党军队有时会优先保障自身部队，导致八路军和炎龙独立军的物资短缺。例如，在一次冬季作战前，急需大量的棉衣和粮食补给。但国民党军队在分配物资时，将大部分物资运往了自己的嫡系部队驻地，使得八路军和炎龙独立军的部分士兵在寒冷的冬天仍身着单薄的衣物，作战和生活受到严重影响。
作战区域划分也引发了矛盾。三方都希望能占据战略位置重要、资源相对丰富的区域。国民党军队凭借其在人数和装备上的优势，试图控制更多的重要城镇和交通要道。八路军则认为自己更擅长在农村和山区开展游击战争，应将这些地区作为主要作战区域。炎龙独立军由于其作战的机动性和特殊性，希望能在日军据点周边及交通枢纽附近有行动自由。各方对作战区域的不同诉求，导致区域划分方案迟迟无法确定，影响了合作的进一步开展。
日军察觉到了中国三方抗日力量的合作意向，深知这将对其在华侵略造成巨大威胁。于是，他们精心策划了一系列阴谋，试图破坏三方刚刚建立起来的合作关系。
日军情报部门派遣大量特务潜入合作区域，利用三方之间已经存在的矛盾和分歧，进行挑拨离间。特务们在国民党军队中散布谣言，声称八路军和炎龙独立军企图在合作中壮大自身实力，夺取国民党的地盘和资源，战后将对国民党的统治构成严重威胁。在八路军和炎龙独立军活动区域，特务们则造谣说国民党军队在合作中会故意保存实力，让八路军和炎龙独立军去送死，还会在物资分配上处处刁难。
此外，日军还采取军事行动进行挑拨。他们故意在八路军和国民党军队的结合部发动小规模袭击，然后伪装成对方部队的样子进行攻击。在一次袭击中，日军假扮成八路军的模样，对国民党军队的一个哨所发动突然袭击，造成了人员伤亡。国民党军队误以为是八路军故意挑衅，愤怒之下准备对八路军采取报复行动。幸亏炎龙独立军及时介入调查，通过对日军遗留武器装备和作战痕迹的分析，识破了日军的阴谋，才避免了一场内部冲突的爆发。
面对这些理念差异、利益纠葛以及日军的阴谋破坏，炎龙独立军、八路军和国民党军队能否化解矛盾，携手共进，成为摆在三方面前的严峻考验。而抗战局势也因这些内部问题变得更加复杂，三方必须尽快找到解决办法，才能继续推进合作，共同抗击日寇。