新势力覆灭后的短暂和平如同一层脆弱的薄纱，在宇宙的暗流中轻轻飘荡。联盟基地沉浸在胜利的余韵里，英博却始终保持着警惕。他站在观测塔顶端，望着深邃的星空，眉头紧锁 —— 每次危机平息后，那种如芒在背的不安感总会愈发强烈。
艾丽娅的实验室里，警报声突然响起。神器表面的符文疯狂闪烁，投射出的全息星图上，无数猩红的光点如病毒般扩散。“英博，快过来！” 她的声音带着前所未有的慌乱，“神器检测到宇宙各处出现异常能量波动，这些波动... 不像是自然现象。”
英博赶到时，屏幕上的景象让他瞳孔骤缩。那些猩红光点以诡异的轨迹移动，逐渐勾勒出一个巨大的、扭曲的图案，仿佛某种远古的召唤阵。“这是... 混沌能量的气息。” 艾丽娅调出数据对比，声音发颤，“根据古老文明的记载，混沌能量是宇宙诞生之初的原始力量，一旦失控，足以将一切回归虚无。”
与此同时，联盟的边境星球接连传来噩耗。最先受到影响的是农业星球 “绿野星”，原本生机盎然的大地突然寸草不生，土壤化作黑色的晶体，空气中弥漫着腐蚀一切的雾气。驻守星球的士兵在通讯中断前，传回了最后画面：无数黑影在雾中穿梭，所过之处，金属与岩石如同被融化的蜡般扭曲变形。
“立刻组建调查小队，前往绿野星！” 英博下达命令，“艾丽娅，继续研究混沌能量的特性，我们需要找到应对方法。”
调查小队抵达绿野星时，眼前的景象宛如地狱。城市废墟中，扭曲的建筑残骸不断渗出黑色黏液，原本清澈的湖泊变成沸腾的毒潭。“这里的能量波动异常紊乱，我们的设备几乎无法正常工作。” 队员话音未落，地面突然裂开，一只巨大的触手破土而出，表面布满眼睛状的凸起，散发着令人作呕的恶臭。
战斗在瞬间爆发。这些被混沌能量异化的生物拥有超乎常理的恢复能力，队员们的攻击刚造成伤口，转眼便愈合如初。更可怕的是，一旦被它们的黏液溅到，战甲会迅速被腐蚀，渗入皮肤的瞬间，士兵的身体开始扭曲变异。
“撤退！快撤退！” 队长嘶吼着，却在转身时被触手缠住。在众目睽睽之下，他的身体被拖入地底，只留下一声凄厉的惨叫。侥幸逃回飞船的队员们脸色惨白，带回的样本在特制容器中疯狂蠕动，似乎想要冲破束缚。
这个消息如同一记重锤，砸在联盟每一个成员心头。英博紧急召开会议，全息投影中，各势力代表的表情凝重。“这些混沌生物的出现绝非偶然。” 英博调出星图上的猩红轨迹，“它们的行动路线似乎在遵循某种指引，而源头... 指向了宇宙的中心。”
一位老学者推了推眼镜，声音颤抖：“传说中，宇宙中心沉睡着一位‘混沌主宰’，是混沌能量的具象化存在。难道... 古老的预言成真了？”
会议室陷入死寂。艾丽娅打破沉默：“不管预言是真是假，现在当务之急是找到对抗混沌能量的方法。我在分析样本时发现，混沌生物对高频震动波和净化能量较为敏感。”
英博立刻下令：“技术团队按照这个方向研发武器，所有联盟舰队进入一级戒备。我们主动出击，沿着混沌生物的轨迹，找到能量源头！”
当联盟舰队集结完毕，准备出发时，后方却传来噩耗。工业星球 “铁砧星” 遭到大规模混沌生物袭击，星球的能量护盾在混沌能量面前如同纸糊的一般。更糟糕的是，星球上储备的反物质能源被混沌生物污染，一旦爆炸，足以摧毁周边三个星系。
“我带小队去铁砧星！” 苏影主动请缨，“必须在反物质能源爆炸前完成净化。”
铁砧星上，情况比想象中更糟。混沌生物如同潮水般涌入能源核心，反物质容器表面布满黑色纹路，倒计时显示还剩不到八小时。苏影带领的小队在粘稠的混沌雾气中艰难前行，每一步都要与异化生物战斗。
“苏影，这里的混沌能量浓度太高，净化装置根本无法启动！” 队员焦急地喊道。苏影看着不断跳动的倒计时，目光落在核心区中央的巨大反应堆上。她突然意识到，混沌能量虽然强大，但本质是无序的，而反应堆的能量运转却是高度有序的。
“启动反应堆最大功率，用有序能量对冲混沌能量！” 她大喊道。队员们面露惊恐：“这样做，星球会先被撕裂的！”
“顾不了那么多了！” 苏影咬牙，“比起三个星系的毁灭，铁砧星必须做出牺牲！”
反应堆轰鸣声震耳欲聋，蓝色的能量光柱冲天而起，与黑色的混沌能量激烈碰撞。苏影操控着净化装置，在能量对冲的缝隙中寻找平衡点。她的战甲在两种极端能量的撕扯下发出不堪重负的呻吟，皮肤被灼出一道道血痕。
当倒计时归零时，净化装置终于启动。白色的净化能量如利剑般穿透混沌黑雾，将污染的反物质能源重新净化。但巨大的能量冲击也让铁砧星开始崩解，苏影带着队员们在星球彻底碎裂前的最后一刻，乘坐逃生舱逃离。
另一边，英博率领的舰队在追寻混沌源头的途中，遭遇了前所未有的危机。一片由混沌能量构成的星云横亘在前方，踏入其中的瞬间，舰队的通讯、导航系统全部失灵。更可怕的是，混沌能量开始渗入飞船内部，船员们的意识逐渐被混乱侵蚀，有人开始疯狂攻击同伴，有人则陷入绝望的呓语。
“用神器！” 英博握紧艾丽娅临行前交给他的神器增幅器，“集中所有能量，制造一个净化力场！”
神器绽放出耀眼的光芒，在混沌星云中开辟出一条狭窄的通道。但随着深入，前方出现了一个巨大的身影 —— 那是由混沌能量凝聚而成的巨兽，它的身体不断变换形态，每一次呼吸都引发空间震荡。
“这就是混沌主宰的先锋吗...” 英博握紧武器，“全体听令，自由攻击，寻找弱点！”
战斗进入白热化。联盟舰队的攻击在巨兽身上激起大片能量涟漪，却无法造成实质性伤害。巨兽张开血盆大口，一道黑色光柱喷出，瞬间摧毁了三艘战舰。千钧一发之际，艾丽娅带着技术团队赶到，他们研发的新型武器 “秩序扰乱炮” 成功击中巨兽的核心，使其短暂停滞。
“英博，它的核心在吸收我们的攻击能量！” 艾丽娅喊道，“必须用相反属性的能量交替攻击，打破它的能量循环！”
英博立刻调整战术，舰队分成两队，一队发射高频震动波，一队释放净化能量。在两种力量的交替冲击下，巨兽终于发出一声怒吼，身体开始崩解。但就在众人以为胜利在望时，巨兽爆炸产生的混沌能量如风暴般席卷而来，英博的飞船被能量洪流冲散，他失去意识前，看到的是星图上那些猩红光点愈发密集的诡异景象......