吴用，字学究，原本是山东济州郓城县东溪村的一位私塾先生，他自幼便与晁盖结识，两人之间的友谊深厚。吴用虽然身处乡间，但心怀天下，智谋过人，常常对世事有着独到的见解。
一天，刘唐匆忙来访，带来了一个重要的消息：梁中书将给太师蔡京献上十万贯生辰纲，这是一笔巨大的财富，足以动摇国库。吴用听后，眼中闪过一丝精光，他意识到这是一个千载难逢的机会。于是，他说服了三阮兄弟，应下了七星聚会的邀请，决定协助晁盖等人智取这笔不义之财。
在吴用的精心策划下，他们成功地劫取了生辰纲，并将财物分给了贫苦百姓。然而，这样的行为自然触犯了官府，为了避免被追捕，吴用与晁盖等人一同上了梁山泊。
到了梁山之后，吴用并没有因为初来乍到而默默无闻。他以其卓越的智慧和见识，很快赢得了众人的尊重。当时，梁山的头领王伦心胸狭窄，不能容人，吴用看在眼里，计上心来。他巧妙地激林冲火并了王伦，为梁山除去了一个绊脚石。随后，众人拥立晁盖为新的头领，吴用则成为了梁山的军师，开始了他的“运筹帷幄之中，决胜千里之外”的生涯。
宋江因在浔阳楼上题下反诗，被黄文炳告发，最终被判定为死刑。消息传来，梁山好汉们无不焦急万分。此时，智多星吴用展现出了他的机智与胆识，他设计让神行太保戴宗传去一封假信，意图通过诡计救出宋江。计划未能如愿成功，吴用的初步尝试宣告失败。
面对这一变故，吴用更加坚定了营救宋江的决心。他迅速调整策略，参与了更为大胆的谋划——劫法场。这是一次充满风险的行动，但为了兄弟情谊，吴用决定放手一搏。在吴用的精心策划和组织下，梁山好汉们齐心协力，终于在危急关头成功救出了宋江。
救出宋江后，众人一同投奔梁山。宋江入伙后，梁山泊迎来了新的篇章。吴用作为军师，再次发挥了关键作用。他运用自己的智慧和影响力，扶持宋江，帮助他在梁山树立威信。在吴用的协助下，宋江逐渐赢得了众好汉的信任和支持，最终坐稳了梁山二把手的地位。
在梁山好汉三打祝家庄的战役中，由于祝家庄地形复杂、防守严密，梁山军队多次受挫，未能取得胜利。面对这样的困境，智多星吴用再次展现了他的卓越智慧，他巧妙地设计了双掌连环计。他派遣孙立等人深入祝家庄内部，作为内应潜伏起来；他安排梁山大军在外形成包围之势，准备里应外合攻破庄院。在吴用的精心策划下，孙立等人成功打入祝家庄内部，与外部的梁山军队形成了有效的配合。在内外夹攻之下，梁山军队成功攻破了祝家庄，取得了这场战斗的胜利。
不久之后，呼延灼率领连环马攻打梁山，给梁山带来了巨大的压力。吴用冷静分析形势，决定采取智取的策略。他派遣时迁等人潜入敌营，巧妙地计诱徐宁上山。徐宁乃钩镰枪法的高手，他的加入极大地增强了梁山军队的战斗力。在徐宁的帮助下，梁山军队成功地破解了连环马的战术，最终打败了呼延灼，保卫了梁山的安全。
在宋江闹华州的事件中，吴用更是展现出了他超凡的智谋。当时，宋江因杀害阎婆惜被发配江州，途中经过华州时，得知史进和鲁智深被关押在华州大牢中。为了救出两位兄弟，吴用精心设计了一个计划。他利用宿太尉金铃吊挂的宝物作为诱饵，成功地吸引了华州高官的注意。在混乱中，梁山好汉趁机潜入大牢，成功地救出了史进和鲁智深。
晁盖在征讨曾头市时不幸被毒箭射中，英勇牺牲。他的离世给梁山好汉们带来了巨大的悲痛，同时也为宋江成为山寨之主铺平了道路。在吴用的提议下，聚义厅被改为忠义堂。
为了壮大梁山的力量，吴用扮作算卦道人，巧妙地计诱卢俊义上山。他散布了卢俊义已经投降梁山的虚假消息，使得卢俊义陷入了困境。
在此期间，梁山好汉们还攻打了大名府，收服了关胜这位勇猛的将领。关胜的加入无疑为梁山增添了新的力量。
在元宵节这个特殊的日子里，吴用再次展现了他的智谋。他命令时迁等人潜入大名府放火，制造混乱。趁着混乱之际，梁山大军攻取了大名府，并成功地收服了卢俊义。
后来，吴用与宋江联合梁山兵马，攻打曾头市。在这场战役中，巧妙地运用反间计，诱使史文恭偷袭，从而成功攻破了曾头市。
在梁山大聚义排列位次时，吴用因其卓越的贡献和智慧，坐上了第三把交椅，并担任梁山掌管机密军师的重任。他多次协助宋江争取招安的时机，为梁山的未来出谋划策。
吴用的智谋和勇气，使他成为了梁山好汉们心中的楷模。他的每一个计策、每一次战斗，都为梁山的壮大和发展做出了不可磨灭的贡献。
梁山好汉在受朝廷招安后，吴用继续辅佐宋江和卢俊义，共同征伐辽国、田虎、王庆和方腊等敌对势力。他凭借出色的军事才能和智谋，为朝廷立下了赫赫战功，被朝廷封为武胜军承宣使
好景不长，宋江最终遭到奸佞之人的陷害而被害。这一消息对吴用来说无疑是晴天霹雳，他深感朝廷之中奸佞当道，正直之士难以容身。同时，他也担心自己会因为与宋江的深厚情谊而受到牵连，遭遇不测之灾。
吴用做出了一个令人痛心的决定。他忠于宋江，不愿独活于世，于是选择与花荣一同自缢于楚州南门外蓼儿洼的宋江墓前。他们用自己的生命，表达了对宋江的忠诚和对朝廷奸佞的抗议。
吴用的离世，让梁山的兄弟们为之扼腕叹息。他的智慧和勇气，将永远镌刻在历史的长河中。最终，吴用的尸身被葬于宋江墓侧，与他的兄弟们永远相伴。