击退幽影族后，灵能多元合作联盟收获的不仅是一场胜利，更是对灵能发展走向的深度思索。在灵能共融理念蓬勃生长之际，一个更为深邃的命题悄然浮现——灵能溯源。联盟高层意识到，若想洞悉灵能的本质，把握未来趋势，就必须回溯到灵能诞生的原点，探寻那被岁月尘封的起源秘密。
联盟紧急抽调各领域精英，组建起“灵能溯源科考队”。科考队阵容堪称豪华，汇聚了联盟顶尖的灵能史学家、考古学家、物理学家以及幻光族、晶汐族的神秘学大师。他们带上最先进的灵能探测设备、古籍解读仪器，登上一艘特制的灵能溯源舰，朝着宇宙深处进发。
根据古老典籍与模糊传说的指引，科考队将目标锁定在一片神秘的“灵墟星系”。星系被混沌迷雾笼罩，灵能波动紊乱且强大，常规航行手段举步维艰。好在幻光族队员施展空间折叠技艺，带领舰队惊险穿越迷雾，眼前出现的是一片荒芜却又透着古老气息的星球群。
科考队降落在一颗布满环形山的星球上，刚踏出舱门，一股磅礴而原始的灵能扑面而来。地面上，刻满了巨大且晦涩的灵能符文，这些符文像是天然生长于星球表面，岁月侵蚀下，依旧散发着微光。考古学家们立刻忙碌起来，小心翼翼地采集符文样本，用灵能扫描仪解析其年代与含义。
在探索一处古老山谷时，队员们意外触发了隐藏的灵能机关。一时间，山谷震动，巨石滚落，从地底涌出一群机械傀儡。这些傀儡身形笨重，却由极为纯粹的灵能驱动，攻击凌厉。科考队成员迅速反应，“耀光箭队”拉弓搭箭，射出蕴含灵能共融之力的箭矢，箭矢击中傀儡，引发能量爆炸，炸碎部分傀儡；“磐岩卫队”则筑起灵能护盾，保护后方科研人员。
激战中，众人发现傀儡守护着山谷深处的一座灵能石门。石门紧闭，门缝中透出神秘光芒。待消灭傀儡后，科考队围聚石门，合力破解开门之法。物理学家通过计算灵能符文的排列规律，史学家从古老传说里找线索，神秘学大师感应石门的灵能波动，终于找到开启石门的灵能频率。
石门缓缓打开，里面是一座宏伟的灵能殿堂，殿堂中央矗立着一颗巨大的灵能晶树。晶树树干粗壮，树枝上挂满了灵能果实，每一颗果实都像是一部灵能史书，封存着远古时代的记忆片段。队员们靠近晶树，用灵能采集器触碰果实，顿时，一幅幅光影画面在殿堂内投射而出。
画面中，宇宙鸿蒙初开，灵能以最纯粹的形态在虚空中飘荡、聚合。最初诞生的灵能生命，身形曼妙，周身环绕着柔和光芒，它们自由穿梭于星系之间，以灵能为笔，描绘出星辰的轨道，孕育出最初的文明。这些文明对灵能顶礼膜拜，用灵能构建城市、创造艺术、延续生命。
然而，随着灵能文明的昌盛，对力量的贪婪与欲望悄然滋生。一场灵能争霸战爆发，各个文明祭出最强的灵能武器，璀璨的灵能光芒变为毁灭的炮火，无数星球在战火中灰飞烟灭。大战让灵能本源受到重创，纯净的灵能被黑暗、混沌所污染，文明纷纷凋零，只留下这些残垣断壁与模糊记忆。
科考队沉浸在这段震撼的历史中，同时也敏锐捕捉到关键信息——灵能天命。传说中，当灵能文明历经磨难，重新寻回初心，便会有觉醒者身负灵能天命，重塑灵能秩序，开启崭新纪元。科考队意识到，当下联盟推动的灵能共融、溯源探索，或许正是走向灵能天命觉醒的关键步伐。
就在众人准备深入研究晶树记忆时，一股黑暗势力悄然逼近。原来，科考队的行动引起了黑暗反盟残党的注意，他们妄图抢夺晶树果实，获取灵能起源秘密，借此掌控宇宙灵能走向。黑暗反盟舰队隐藏在星系边缘的陨石带后，趁科考队专注研究时，发动突袭。
黑暗灵能炮火如雨点般轰向星球，科考队所在的殿堂剧烈摇晃。“星耀灵能军团”立刻组织防御，战舰升空，与敌舰展开激烈空战。可黑暗舰队数量众多，且装备了新型黑暗灵能武器，联盟战舰一时间陷入苦战。
杨博、林凡等强者则守护在殿堂内，抵御黑暗势力的地面部队。黑暗机甲战士与邪恶魔兽潮水般涌来，杨博施展出“七彩灵耀·溯源混沌击”，七彩光芒裹挟着对灵能起源的感悟，净化大片黑暗气息；林凡发动“星辰浩渺·灵界天命杀”，星辰之力与灵能天命的潜在意志共鸣，斩杀黑暗生物。
但黑暗势力攻势不减，眼看晶树果实就要被夺走，科考队成员急中生智。他们利用殿堂内的古老灵能机关，激活了一道强力的灵能守护屏障。屏障光芒万丈，暂时挡住了黑暗进攻，同时，科考队争分夺秒，拷贝下晶树果实内的关键记忆，而后摧毁果实，防止落入敌手。
联盟舰队在苦战中，逐渐摸清黑暗舰队的破绽。科研人员远程操控，调整战舰灵能共融模式，集中火力攻击黑暗舰队的能源中枢。在一轮齐射中，数艘黑暗战舰能源失控，发生爆炸，连锁反应下，黑暗舰队阵型大乱。
“星耀灵能军团”乘胜追击，彻底击溃黑暗反盟残党。经此一役，科考队带着珍贵的灵能起源资料返回联盟。这些资料在联盟内引发轰动，学者们日夜钻研，从历史中汲取智慧，进一步完善灵能共融体系，还开启了“灵能天命觉醒计划”。
联盟鼓励全体灵能者内省修行，感悟灵能的初心与使命，挖掘自身潜在的天命之力。年轻的灵能者们踊跃参与，在冥想室、灵能修炼场中，探寻与灵能本源的深层连接。随着越来越多人踏上觉醒之路，联盟内弥漫着一股蓬勃向上的精神气息，仿佛真的在一步步靠近那重塑灵能秩序的伟大天命，向着未知而充满希望的未来昂首迈进。