刘秀建立了东汉王朝以后，其实当时还并没有完成大统一的局面，所以刘秀的皇帝道路还没有达到巅峰。
当然了，这个时候的更始皇帝刘玄的日子也不好过，当时的赤眉军已经拥立了傀儡小皇帝刘盆子，并且还建立了建世政权，同时拥兵三十万，而更始政权的绿林军多次与绿林军交战都是大败而归。
最后更始皇帝刘骜投降了赤眉军，随后刘玄被赤眉政权封了个长沙王，当然了，一般像刘玄这种情况那肯定是活不了多久的，所以很快刘玄就被人给随便找了个借口给缢死了。
此时的刘秀就利用了赤眉和绿林的相互厮杀的空隙，率领二十八将进军关东。
当时赤眉军正好遇到了灾荒年，十万大军困在长安城里断了粮，所以赤眉军只能撤出长安去找粮食，结果又遇到了百年不遇的大雪，后来被冻死了大半兵马的赤眉军又返回长安。
此时刘秀遣冯异攻打赤眉军，但是屡战屡败，冯异只能采用坚壁清野的战术和赤眉军死磕到底。
不久后冯异在渑池和赤眉军决战，从早上打到太阳落山，这才重创了赤眉军。这就是所谓崤底之战。
崤底之战以后，赤眉军被逼到了宜阳，刘秀又率领六军一路追杀赤眉军，直到赤眉军投降交出了从更始皇帝刘玄，而且最后还刘秀抢走了传国玉玺和刘玄的皇帝佩剑，
至此山东的赤眉军这才算彻底歇菜了。
就在刘秀和赤眉军死磕的同时，刘秀还派出了虎牙将军盖延在函谷关一线进行东征，直到到建武六年刘秀才彻底的收复了关中地区。
随后也是建武六年，刘秀派建威大将军耿弇等七将军从陇西攻蜀，而陇西的隗嚣开始的时候还利用陇西的地形优势，连连挫败了汉军的军事打击，但是最终也抵挡不住刘秀的几路围歼战，最后隗嚣手下的大将马援也投降了刘秀，这位就是后来威震华夏的伏波将军马援。
当时刘秀给马援五千骑兵去招降隗嚣部属和羌族豪长，想在内部分化瓦解隗嚣。
结果这位隗嚣不但没有投降刘秀，反而是向公孙述投降了，其实隗嚣这么做也并不算是奇葩，毕竟敌人的敌人就是自己盟友。
结果这位公孙述也不和隗嚣客气，直接封隗嚣为宁王，并且继续去和刘秀对抗。开始的时候隗嚣还是夺回了陇西的部分地区的，但是等隗嚣了自然死亡以后，隗嚣的儿子隗纯就接替了了父亲的王位。
最后直到建武八年，隗纯投降了汉军，随后刘秀又用了四年的时间才收复陇西地区。
平定陇西后，刘秀又从南北两个方向，对巴蜀益州的公孙述展开了攻势。
建武十一年三月，大司马吴汉率荆州兵六万顺着长江西侧进攻巴蜀，大军顺着三峡长驱直入的就到了江关，后来又直破江州。同年六月汉军攻破平曲。
建武十二年大将吴汉败蜀军于鱼腹津，并且歼灭蜀援军五千余人，随后西上再破广都逼近成都。但是由于吴汉求胜心切，所以在成都没讨到多少便宜，随后吴汉转变战术乘夜撤到锦江南岸与副将刘尚合兵，这才转败为胜。
此后吴汉又根据刘秀布置的战术，与蜀军战于成都广都之间，随后就歼灭了公孙述的主力部队，最后大军终于来到了成都城下。
十一月，大将臧宫攻克繁城与吴汉会师合围成都。
公孙述临时羡招募了五千新兵继续对抗，虽然也打败了吴汉，但是终究还是兔子尾巴长不了几天了，随后吴汉隐蔽精锐诱敌深入，公孙述贸然出击结果就是重伤战死。大将延岑也很快投降了刘秀。
至此从刘秀登基以后，一直到了建武十二年，东汉光武帝刘秀灭赤眉收关中，收陇西攻巴蜀这才算完成了大汉王朝的又一次大统一。