朱载坖在这个时候宣布征讨北虏，不仅仅出乎了所有重臣们意料之中，更是出乎了这些使节们的意料之中，除了尼德兰等西洋的使节没什么表现之外，朝鲜、倭国、土默特等番邦属夷和使臣们，一个个都若有所思，大明陈兵数十万，朱载坖这个皇帝当着这么多的使臣面前，宣布诏命，征讨北虏，不仅仅是要打土蛮部，更是要警告这些在场的使臣们，要是跟大明玩什么心眼，大明天兵随时都可以征讨他们。
戚继光和李成梁领受印信，准备出征，朱载坖起身说道：“恭行天讨，肃清逆贼！”同时将象征大将专征之权的符节授予征虏大将军戚继光，大阅以一众满朝臣子和使节们都没有想到的方式结束了，大明征讨土蛮，最积极的都是土默特部的使节了。
之前朱载坖已经询问过顺义王乐，顺义王也答应过大明愿意帮助大明，朱载坖也提前给土默特部下旨，要求土默特部配合李成梁，接受李成梁的指挥，而当天，两路官军就开拔出征，踏上了征讨土蛮的道路。
为了统一步调，戚继光部要行动的更快，因为官军主力要先抵达辽东与辽东官军会和之后再从辽东赶赴松原，而戚继光在路上已经传檄提督蓟辽军务黑春和辽东总兵严绍庭，查探从沈阳到松原的道路，提前修复道路，为官军主力行军扫清障碍，同时传檄女真人出兵助战。
对于朱载坖出兵征讨土蛮，朝廷上并没有多大的议论，这么多年朝臣们对于朱载坖已经是很了解了，对于蛮夷，朱载坖一向是征讨为先，怀柔为后，对于土蛮这种一向不怎么恭顺的胡虏，朱载坖部征讨才是怪事了，朱载坖征讨土蛮，并不出臣子们意料之中，不过规模这么大的用兵，确实是非常是罕见的，土蛮能够集结的兵力不过十万，而官军投入两倍于土蛮，可见朱载坖对于土蛮的厌恶，大明征倭不过出动十五万人，征讨土蛮的兵力远远超过了征讨倭国的兵力。
李成梁部的行军速度要稍微慢一些，一方面是为了和戚继光部协调一致，另一方面是为了等待土默特部集中兵力，毕竟土默特部刚刚收到朱载坖的旨意，还要集结部队，肯定是需要时间的，这点李成梁还是明白的。
虽然大军已经出征，但是朱载坖却再次抱病，将庶务交给了太子处理，自己再次和李皇后、贵妃还有两位公主迁居西苑玉熙宫，这再次引起了臣子们的不满，虽然朱载坖这次安排了太子处理政务，但是皇帝再次迁居西苑，总归让臣子们有些不好的联想，不过朱载坖确实是病了，从参加大阅回来之后，朱载坖就受了风寒，不过这次风寒来的颇重，再加上朱载坖如今四十九岁了，身体大不如前，这次风寒着实使得朱载坖大病一场，更加不愿意呆在宫内，所以朱载坖不顾臣子们的劝阻，迁居西苑，指令次辅张四维、兵部尚书徐渭、总督京营定国公徐文壁、锦衣亲军都指挥使陆绎等亲近臣子才能够进出西苑，向朱载坖奏报中外见闻。
翰林医官中只有许长龄在朱载坖身边伺候，但是许长龄并不善于调离和治疗风寒，他也多次请求朱载坖选择更好的医生，朱载坖思来想去之后召见了万密斋之子万邦忠到西苑来伺候，同时召张国祥，要求他推荐一些道医来，不是要炼丹的那种货，而是真正的医生，同时翰林医官们也分批到西苑诊视，但是具体到用药环节，则是许长龄、万邦忠两人负责。
其实朱载坖的病已经痊愈了，只是上了年岁之后，精力大不如前，处理政务不能够像之前那样通宵达旦，宵衣旰食了，为了此事许长龄和万邦忠已经多次提醒过朱载坖了，长期批阅奏疏，对于朱载坖现在的身体是极为不利的，所以朱载坖这次将庶务都交给朱翊釴处理，自己只处理军国大事。
不过在西苑待了一段时间之后，朱载坖也有些待不住了，没有了每天了奏疏渎扰，朱载坖反而有些不太习惯了，虽然许长龄等医生一再劝说朱载坖再修养一段时间，但是朱载坖有些按耐不住了，虽然没有处理政务，但是密集的召见郑王和郑王世子朱载堉，还有化学研究院的一众道士们。
朱载坖关心的首先就是蒸汽机的进展，作为现在朱载坖最关心的项目，虽然有了可以实用的蒸汽机，但是现在的蒸汽机问题很多：效率很低，为了维持机器的运转需要烧很多的煤，好在它本身就是用于煤矿抽水的，煤有的是。但它靠压力输送水，又因材料制造和焊接工艺的不足致使管道时有发生断裂和爆炸，同时依靠大气压提水，最高提升高度约为三丈。
而且气缸每次循环中大约有四分之三的蒸汽热量被白白地浪费，而且由于每次循环都向气缸内喷入冷水不能连续工作。这些问题确实是难以解决的，朱载坖认为，首先还是要首先解决相应的一些基础问题，首先就是气压计，有了气压计，才能够测定蒸汽气压，使得蒸汽机能够实用化，朱载坖不得不祭出托里拆利实验了，其实是非常简单的原理，一只手握住玻璃管中部，在管内灌满水银，排出空气，用另一只手指紧紧堵住玻璃管开口端并把玻璃管小心地倒插在盛有水银的槽里，待开口端全部浸入水银槽内时放开手指，将管子竖直固定，当管内水银液面停止下降时，读出此时水银液柱与水槽中水平液面的竖直高度差，逐渐倾斜玻璃管，发现管内水银柱的竖直高度不变。
说明空气中也是存在压力的，按照这个思路去制造可以实用的气压计，测定蒸汽机的气压，当然现在不能叫托里拆利实验了，得叫隆庆实验了。