朱载坖虽然是灵机一动将此事派给了太子，但是也是有把太子从此事中撇开的意思，除了山西走私案之外，接下来的清查军储一样会将相当多的人牵连进来，甚至不少人要人头落地，这些赃活，朱载坖现在是不会让朱翊釴介入进来的。
第二天李朝观将将朱载坖所需要的东西以奏疏的形式密奏朱载坖，至于银子，会分批解运到内承运库的。朱载坖对于这些资料是极为重视的，上面不光有晋商走私的各处路径，还有晋商在官军中安插的子弟，他们在蒙古那边的固定缴获地点等等。
最令朱载坖重视的就是李朝观有关军储的信息，作为长期从事开中的大粮商，李朝观当然知道大明九边军储的一些情况，说个实话，军储的情况比朱载坖想象的要好多了，甚至比太仓的情况都要好些，虽然一样存在京通仓的各种毛病，也存在盗卖军粮，实贮不足的情况，但是比之朱载坖想象的大量贪墨已经好很多了，朱载坖原本是做好了军储亏空三分之一的准备的。
现在根据李朝观提供的信息，军储的缺额大概在六分之一到五分之一间，虽然这个数字也是十分庞大的，但是还是能够纠正的，而且军储上的很多猫腻也确实存在，像李朝观就是坦陈，开中商人为了节约成本，会买通仓库的官吏，短斤少两，甚至将原本应该缴纳的本色变成折色，变相的增加士卒手中的折色比例，这都是朱载坖严令禁止的，朱载坖不能允许本色的减少，因为本色是士卒甚至是一家人糊口的粮食，一旦减少，那是要出大事的。
朱载坖一面命令陆绎密查此事，另一面结合这些晋商提供的情报准备有针对性的动手了。
李朝观向朱载坖提供了这些晋商走私的主要路径，那么在这整个路径上的边堡都肯定是有问题的，朱载坖不敢赌，只有全部予以更易，同时还有这些晋商给朱载坖提供的一些名单，有些是在宣大三镇中比较要害地方的军官，但是朱载坖不会着急立马动手的，朱载坖必须验证这些情报的真实性。
而且现在朝廷已经采取的种种手段加强对于山西的控制，朱载坖认为，他们铤而走险的可能性还是不大的。所以朱载坖给郑洛、张四维等人下旨，将这些走私道路上的军官予以更易，同时根据现有的情况，抄没一两家走私商人，现在对于朱载坖来说最大的问题就是只有口供，没有走私的确凿证据，毕竟朝廷没有逮到过走私的现场，未免会让人觉得朱载坖是在借机打击商人。
朱载坖不但要获取口供，还需要各种证据，将此事做实，这就不仅仅需要在大明内部动手了，还需要蒙古人方面的协助，朱载坖很清楚，把汉那吉作为蒙古方面负责贡市的头领，对于走私肯定是极为清楚的，而他不管是出于什么原因，并没有向朝廷汇报此事，这是对于朝廷的藐视，朱载坖不能等闲视之。
朱载坖命令礼部，立刻遣使把汉那吉部，责问此事，要是不能给大明一个合理的解释，那朱载坖既要停止对把汉那吉的支持，让他自己去面对黄台吉，这对于把汉那吉肯定是极为致命的，现在俺答还活着，黄台吉自然不会对把汉那吉做什么的，可是一旦俺答去世，黄台吉会不会动手就难说了。
朱载坖知道，把汉那吉就是短视，他意识不到自己现在的处境，认为朱载坖一定会支持他，似乎大明没有其他的人选，朱载坖必须给把汉那吉提提醒，不是大明需要他，而是他需要大明，现在的把汉那吉，看起来春风得意，那都是建立在俺答还活着的前提下的。
一旦俺答去世，失去了俺答的庇佑，把汉那吉的日子就不会好过了，黄台吉要是夺取了大汗和顺义王的位置，对于把汉那吉来说，那就是十分要命的，黄台吉觊觎他的部落不是一天两天了，更不会容忍把汉那吉继续把持和大明的贡市这个肥缺的，把汉那吉能够混个自然死亡都难。
而要是三娘子和不他失礼上位，把汉那吉也未见得就会好过，毕竟把汉那吉和三娘子的关系并不好，而且三娘子能放任把汉那吉继续把持和大明通贡这个肥差吗？显然是不可能的，要知道黄台吉被按下去之后，把汉那吉就是在土默特部中能够和不他失礼争锋的人选了，要是没有大明的支持，三娘子会继续放任把汉那吉把持贡市，扩张力量吗？这是绝对不可能的。
所以朱载坖必须要让把汉那吉弄清楚，能够让他坐稳这个位置，并且保证他的安全的就只有大明，在俺答故去之后，能够庇护他的就只有大明了，要是大明将他抛弃了，把汉那吉的下场绝不会很好。
所以朱载坖要求礼部和宣大的使者态度一定要强硬，要震慑住把汉那吉，朱载坖很清楚，当年把汉那吉能够逃归大明，说明他并不是蠢人，只是这两年安逸日子过多了，懈怠了而已，他反应过来之后，是能够权衡利弊的。
除了这些事情，朱载坖还授意练兵军务处领导兵部、五军都督府在宣大、山西三镇内部进行调防，彻底杜绝发生兵变的可能性，同时在锦衣亲军和卫尉寺的配合下，先对军中参与走私的军官予以缉拿，这些商人是跑不掉的，只要能够稳住官军，后面的事情都好说。
朱载坖给张四维等人的命令是先官军再地方官府，最后才是这些商人，一步一步的收网，同时从京师派遣锦衣亲军，在山西通往外省的要道上设卡，堵截这些不法商人，在完成好了宣大三镇官军的调防，还有从京师调来的大量补充军官抵达山西之后，张四维向朱载坖请旨行动。
朱载坖御批同意，命令厂卫等各衙门配合张四维、马芳的行动。