朱载坖对于科道的雷霆手段还是震慑住了一些人，他们现在知道朱载坖并非什么善类了，他对于厂卫的应用和嘉靖是一样的，只不过朱载坖可能没有嘉靖那么爱杀人罢了。
现在内阁的形势就很诡异了，内阁现在是很明显的分成了三派，徐阶和张居正是一派，他们和高拱、郭朴一派斗争的十分激烈，此外就是李春芳和陈以勤，他们两人都是相对比较温和，在对这种斗争能不参与就不参与，是属于内阁中其他两派的拉拢对象。
不过李春芳显然对于介入内阁的这些斗争毫无兴趣，陈以勤本身就是老好人一个，谁都不得罪，所以内阁现在的情况算是达成了一个微妙的平衡。
但是明眼人都知道，这种平衡是很难维持长久的。很快，由于户部尚书的人选问题，徐阶和高拱的矛盾再次激化，由于之前户部尚书高耀在嘉靖时多有应奉嘉靖修玄的事情，同时为了奉承嘉靖，高耀多次动用太仓银以供嘉靖采买等，这些事情在这次的京察中高耀遭到了言官们的疯狂弹劾。
高耀也很清楚，今年朱载坖初登基，下诏免除天下田租一半，国家仓库入不敷出，京、通二仓也积聚不多，现在这个户部尚书，搞不好就得背锅，高耀索性借机上疏朱载坖求去，对于高耀的上疏求去，朱载坖当即予以批准，但是户部尚书一职空缺，谁来担任也就是大问题了。
徐阶属意南京户部尚书马森，而高拱等人则属意户部左侍郎刘体乾，马森是徐阶十分器重的人，嘉靖十四年进士，颇有清名，任大理寺卿时，屡驳疑狱，与刑部尚书郑晓、左都御史周延称为\"三平\"，是清流的中坚人物，而且是福州人。
而刘体乾是直隶东安县人，和高拱、郭朴一样是北方人，其实这种斗争已经变成了南北方官僚集团的斗争了，朱载坖对于这些事情是心知肚明的，他觉得召集内阁和吏部尚书杨博来商量此事。
在文华殿内，朱载坖将阁臣和吏部尚书杨博叫来，朱载坖问道：“大司农的人选，一直悬而未决，不是办法，今日请诸位来，是当堂商量人选，诸位可以畅所欲言。”
徐阶当然还是力挺马森，马森的优点也很明显，他资历深厚，是嘉靖十四年进士，颇有清名，操守极佳，马森当考官时，宰相夏言的女婿是他的门生，要介绍他去见夏言，他谢绝了。夏言的政敌严嵩闻知很高兴，但马森也不依附严嵩。而且从南京户部尚书转任户部尚书也算是正常操作，符合惯例。
而刘体乾则以刚直着称，在湖广、江西任上，追缴欠粮，颇为得力，这是刘体乾最大的优势。高拱之所以推荐刘体乾，就是因为高拱也看到了现在太仓空虚，由于今年的减免赋税，朝廷的用度肯定会更加困难，这个催征欠粮就显得更加重要了，刘体乾的强悍作风有利于更好的催征欠粮，保障朝廷的收入。
但是在资历和名声上，刘体乾确实是不如马森的。
朱载坖首先问杨博道：“天官怎么看此事？”
杨博说道：“陛下，臣以为马森、刘体乾皆一时之选，臣惟陛下命！”
虽然杨博也是北方人，但是在这个问题上他也不敢轻易得罪徐阶，毕竟在现在的朝廷，南方官员势大已经是很长久的事情了，毕竟在科举上，东南确实是占有优势的，更何况杨博还有自己的打算呢。
高拱等人也陈述了自己的意见，高拱主要是认为马森之前没有从事过与财赋有关的工作，南京户部的压力和户部比起来不可同日而语，而且今岁的财政形势如此严峻，如果不找一个作风强悍的户部尚书，严督地方，催征税粮的话，恐怕朝廷的日子不好过。
朱载坖对此事也确实是很担心，催征是个很要命的问题，但是户部并不是没有严督地方，收效甚微罢了，在马森和刘体乾的问题上，朱载坖决定暂时支持徐阶，一来是现在朱载坖需要徐阶来完成过渡，不能使得朝廷过于动荡，不要过分刺激东南士绅集团，同时朱载坖在户部尚书的事情上对徐阶妥协了，其他的事情上朱载坖就要有所说活才行。
于是朱载坖拍板，马森任户部尚书，刘体乾接任南京户部尚书兼总督粮储，督理浙直粮饷，将大明最重要的催征任务交给了刘体乾，也算是朱载坖对他的考验，一旦刘体乾在这个位置上作出成绩，立马就可以得到提升。
对于这个决定，徐阶和高拱都算满意，徐阶维护了自己的首辅权威，而高拱举荐了刘体乾也正式迈入部堂大员的行列，只要有机会，去掉南京是很简单的事情。
这个时候，杨博说道：“陛下，刘体乾升任南京户部尚书，所空缺的户部左侍郎，应当由何人递补？”
朱载坖当然知道杨博在想什么，随即说道：“天官觉得，现任户部右侍郎总督仓场王国光如何？”
杨博赶紧说道：“王国光是臣的乡党，臣不当言。”
朱载坖笑着说道：“朕不是问王国光的乡党杨博，而是问朕的吏部天官，王国光何等样人？”
杨博说道：“陛下，以臣愚见，王国光精于财赋，善于计算，使之居户部，正得其才也！”
朱载坖于是说道：“既如此，就升王国光户部左侍郎，仍兼总督仓场，先让他把仓场理顺，再到部上任。”
杨博赶紧领命，对于京通仓，朱载坖一向是十分重视的，京通仓关系了京营和蓟镇、辽东、宣府等处官军的军粮，关乎这九边宁定，之前严世蕃督察仓场，就已经发现了许多问题，但是当时来不及解决，现在朱载坖上位，当然要狠狠的整顿京通仓，王国光被杨博所推崇，那就拿仓场试试王国光的本事。
朱载坖解决了这些问题之后，隆庆元年的京察才算是告一段落。