确实如众人所料，郭致远把这件事闹得这么大，陈子贞就算有心想帮他遮掩也遮掩不住，只得如实向朝廷汇报，其实即使陈子贞不向朝廷汇报，朱恭枵也不会善罢甘休，当代周王朱肃溱在听了宝贝儿子一通哭诉后勃然大怒，亲自跑去京城向万历皇帝告御状！
此时东林党人已经渐渐从“乙巳京察”和浙党的党争中恢复了元气，在朝中的影响力越来越大，就连接替李廷机任首辅的叶向高也偏向东林党人，这个时候的东林党人已经完变成了一个严重排他的政党，任何非东林党人只要被他们抓住辫子都会遭到他们的疯狂攻击，现在郭致远做出这么胆大妄为的事，东林党人自然不可能放过这么好的机会，弹劾他的奏折如雪片般飞到万历皇帝的案头！
万历皇帝一听此事也是雷霆震怒，气得当场拍了桌子，把案头上的奏折扫落一地，怒不可遏道：“这个郭致远太无法无天了，他眼里还有朕吗？还有朝廷吗？简直是罪该万死！……”
那些对郭致远印象还不错的大臣也不好帮郭致远说话了，郭致远连绑架周王世子这种大逆不道的事都做出来了，这个时候还帮他说话不是给自己找不自在吗？所以朝堂上对此事的态度几乎是一面倒的，就是一定要严厉处置郭致远！
不过在如何处置郭致远这件事上群臣却起了分歧，东林党人的意见是直接将郭致远按叛党论处，派大军去东蕃，将郭致远缉拿回京城下狱治罪！
而温和派的大臣则认为郭致远此举虽然有些胆大妄为，但直接按叛党论处似乎有些过了，毕竟郭致远并没有公然造反，而且更关键的是如今朝廷国库空虚，根本没有能力发动一起大规模的平叛战役，派去大军去东蕃风险太高，若是打赢了还好说，若是打输了呢，那不就更打脸了吗？
当然后面的话没人敢当着万历皇帝的面说出来，主持兵部的几位大臣只是说调动大军不易，朝廷还欠着大批军饷没发呢，能够不动兵戈还是尽量不动的好。
这下轮到万历皇帝头疼了，现在的他已经不复当初发动“三大征”时的雄心勃勃了，他只想当个太平皇帝，能不搞事情尽量不搞事情，看着殿下争论不休的群臣，他有些疲惫地敲了敲额头，这个该死的郭致远怎么就不能安分一点呢，朕已经睁一只眼闭一只眼了，你干嘛非要逼朕呢？
此时内阁无人，万历皇帝能够倚重的就只有首辅叶向高了，所以只能把目光投向他，拖长音调问道：“叶爱卿，你意下如何啊？该如何处置此事啊？……”
叶向高虽然偏向东林党人，但是他此时一人主持内阁，等于一个人要干好几个人的事，也被繁杂的朝政事务搞得精疲力竭，所以不像东林党人那样不当家不知柴米油盐贵，知道此时的明朝已经是一堵到处漏风的墙，能够维持这堵墙不倒已经是极限了，根本没有能力派出大军去东蕃。
叶向高本身是福建人，虽然已经离开家乡多年，但是通过家乡亲友的书信往来对郭致远这个人还是有些了解的，方才朝堂上一面倒地谴责郭致远大逆不道，他也不好帮郭致远说话，现在万历皇帝点了他名，他也不好不发表意见了，站出来道：“启奏圣上，老臣以为郭致远确实胆大妄为，公然绑架皇室宗亲，不惩戒不足以正朝纲，但若说他有反叛之心，却也未必，这些年东蕃一直按时向朝廷缴纳税银，而且其父郭正域向来忠君体国，如今也在东蕃，绝不可能坐视其子行反叛之事，如今国库空虚，确实不宜轻动兵戈，不若下旨将其降职，令其进京反省，再遣一能臣前往东蕃接替其任东蕃知府，观其反应，若是郭致远不肯接旨，则说明其确有反叛之心，到时再论出兵平叛之事不迟……”
万历皇帝一听眼睛就亮了，他还惦记着东蕃每年上贡的二十万两税银呢，要是郭致远真的反了，朝廷不就少了一条财路？将郭致远降职，削了他的权，只要郭致远肯来京城，就不怕他能翻天了，再派个能干的大臣去接替他的位子，慢慢将东蕃掌控回朝廷手中，岂不是更好？
想到这里，万历皇帝兴奋地一拍巴掌，高兴道：“叶爱卿不愧是朕的肱骨之臣，此议甚妙！那就按叶爱卿所奏，将郭致远降职为六品，即刻进京反省，另着吏部甄选能臣前往东蕃接替其东蕃知府之职……”
东林党人虽有些不甘心，不过叶向高提到郭正域，他们也不好再死咬着郭致远不放了，郭正域可是根红苗正的东林党人，虽然去了东蕃以后联系少了，但要说郭正域也和郭致远一样起了反叛之心，那岂不是打东林党自己的脸吗？所以也只能退而求其次，同意叶向高的提议，派人去东蕃接替郭致远任东蕃知府。
本来像这种外放的肥差，朝中各派势力历来是要争得头破血流的，不过这次要派人去东蕃接替郭致远任东蕃知府愿意去的人却很少，开玩笑呢，郭致远连周王世子都敢绑架，这要是再犯起浑来，只怕知府位置还没坐稳，脑袋就搬家了，傻子才愿意去冒这个险呢？
这个时候东林党人当仁不让地站出来了，你们不敢去，我们派人去！不得不说东林党人中还是很有些不怕死的，像着名的“东林六君子”杨涟、左光斗等人都是出了名的硬骨头，尤其这个时候的东林党人更是个个以敢于向皇帝死谏自傲，抛开历史功过不论，仅就这一点论东林党人还是有其可敬之处的。
东林党人揽下了这个烫手的山芋，不过他们也知道要对付郭致远绝不容易，郭致远如果没两把刷子也不可能在东蕃开创如此局面，让朝廷都投鼠忌器了，所以这个派去接替郭致远的人除了要不怕死外，还要对郭致远足够熟悉，不会轻易中了郭致远的圈套，最后东林党人商量来商量去，决定派郭致远的一个老熟人去接替他。
（注：叶向高(1559年9月1日-1627年10月7日)，字进卿，号台山，晚号福庐山人，福州府福清(今福建福清市)人。万历、天启年间两度出任内阁首辅。关于叶向高是否属于东林党人，史上颇有争论，在魏忠贤阉党党羽王绍徽等撰写的所谓《东林点将录》中，曾将叶向高列为东林党党魁，不过笔者翻阅诸多史料，觉得叶向高虽然在政治倾向上偏向于东林党人，但在其主持朝政期间，其作为和东林党还是有区别的，并不是真正的东林党人。）