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各位同行,他的开场白简单直接,数个月前,我们通过《细胞》特刊,向学界汇报了关于枢纽蛋白的发现。今天,我站在这里,看到这个理念已经在全球各地生根发芽。

“我想借此机会,向全球学界汇报繁缕研究院在过去数年里,针对这一核心问题所进行的一些探索,并提出我们的一项初步解决方案。”

“关于一类特殊蛋白质家族的定义、鉴定标准及其在细胞生物学中核心地位的框架性构想。”

他身后的巨大屏幕,以及会场穹顶的环形屏幕,同步亮起。

画面中央,浮现出四个沉稳而充满力量的中英文字符:

枢纽蛋白 - hub proteins

短暂的寂静后,会场响起一阵低低的议论声。

大屏幕上开始展示令人震撼的数据:全球已有327个实验室成功重复了枢纽蛋白的关键实验。

超过1800篇预印本论文引用了这一发现。

甚至已经有制药巨头依据该理论开始研发新一代靶向药物。

“枢纽蛋白”?这个概念并非完全陌生,因为这是由繁缕研究院率先提出来的学术概念。

在以往的蛋白互作网络分析中,节点度高的蛋白有时会被冠以类似的称呼,但从未有人将其提升到一个需要严格定义和标准化的高度。

“请注意。”陆时羡的声音再次响起,压下了现场的嘈杂,“我们所说的‘枢纽蛋白’,并非简单基于互作伙伴数量的统计学概念。它代表着一类在细胞生命活动中,扮演着核心调度与整合功能的关键分子。它们或许不是数量最多的,也未必是表达量最高的,但它们处于信息流与调控网络的战略要冲,其微小的扰动,便可能引发整个细胞状态的系统性、全局性变迁。”

紧接着,他抛出了今晚最重磅的内容,枢纽蛋白的三大核心鉴定标准与量化体系。

但是。陆时羡话锋一转,随着研究的深入,我们发现了一个迫切的需求,我们需要这个全新的领域制定标准。正如当年dNA双螺旋结构发现后,我们需要统一的命名规则和研究规范。

全场寂静。

所有人都已经意识到,这是一个领域奠基者在为整个学科制定游戏规则。

今天,我要公布的是枢纽蛋白的四大核心鉴定标准与量化体系。陆时羡的声音清晰而坚定。

这套标准包括四个核心部分。

大屏幕上展示出一个精密的数学模型。

“第一标准是动态中心性指数。”

“传统的网络中心性指标是静态的。我们引入了时间维度与空间维度,要求一个合格的枢纽蛋白,必须在细胞特定生理状态或应激反应下的动态网络重构过程中,持续保持其中心地位。”

“我们开发了相应的算法‘centi-dyna’,并设定了阈值:其动态中心性指数必须稳定高于0.85。”

屏幕上开始动态演示一个复杂的蛋白互作网络,其中数个节点散发出强烈的光芒。

台下一位计算生物学家忍不住倒吸一口凉气。0.85!这个阈值高得惊人,意味着几乎不允许有任何波动。

“第二标准是功能整合权重。”

陆时羡没管众人的惊叹,而是继续介绍道:“一个蛋白仅仅位于网络中心是不够的,它必须能证明自己实质性地整合了来自不同上游通路的信息,并向下游多个功能模块发出协调指令。”

他展示了一系列精密的实验数据与数学模型:“我们构建了‘功能整合权重’模型,通过量化其输入信息的多样性与输出指令的全局影响力,来评估其整合能力。权重低于0.7的蛋白,将不被纳入枢纽蛋白范畴。”

这一标准,直接将那些虽连接众多但只是“信息中转站”的蛋白剔除出去,直指真正的“决策者”。

“第三标准是表型调控强度。”

画面切换,展示的是利用繁缕研究院独有的高通量基因编辑与单细胞测序技术平台,对成千上万个潜在枢纽蛋白进行系统性敲除或扰动后的表型分析结果。

“最终的裁判,是细胞本身。”陆时羡的语气斩钉截铁:“我们要求,枢纽蛋白的失活或异常,必须能在单细胞分辨率上,引发显着、特异、且跨越多个细胞功能模块的综合性表型。其表型调控强度指数需大于等于8.5。空有网络地位而无实际功能掌控力者,不足以称‘枢纽’!”

这个清晰的核心体系让在场学者纷纷点头。

剑桥大学的哈灵顿教授低声对助手说:这就像门捷列夫制定元素周期表,他正在为细胞生物学建立新的秩序。

三大标准,环环相扣,从网络拓扑结构到功能验证,从计算预测到实验实证,构建了一个逻辑严密、要求极其苛刻的鉴定体系。

会场内一片寂静,所有人都被这前所未有的高标准和系统性震撼了。

陆时羡给了众人片刻消化的时间,然后缓缓说道:“基于以上标准,我们对人类细胞中超过两万个高置信度蛋白进行了系统性评估。”

“初步结果表明,符合枢纽蛋白严格定义的,目前仅有127个。”

一个具体的数字,让现场的震撼达到了顶点。

数万个蛋白中,仅有127个!

这是何等的精益求精!

“这127个枢纽蛋白,构成了细胞功能大厦的‘承重墙’与‘调度中枢’。”陆时羡的声音带着一种引导性的力量。

“理解它们,靶向它们,将为我们理解细胞命运抉择、疾病发生机理、乃至开发新一代精准医疗策略,提供前所未有的清晰视角和强大杠杆。”

他随即展示了几个范例。

一个过去被认为只是普通信号分子的蛋白,如何被证明是协调细胞代谢与自噬的核心枢纽;一个功能未知的蛋白,如何被揭示出是维持基因组结构稳定性的关键调度者……

每一个案例都辅以海量的、无可辩驳的数据,其分析深度与视野广度,令在场专家叹为观止。

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