这次军政会议结束之后，赵子良又在当天下午召集军中大将们商议军队整编之事，从中原带回来的九万余西秦军经过多次整编无论是在作战上还是在指挥上都很适合当年的情况，因此无须再进行整编，只有一直留在西秦的三万余兵马需要进行整编。
赵子良对赵虎、霍堪、魏勐、玄一、玄二等留守的大将们说道：“让你们过来，就是要跟你们商量留守西秦的三万军队的整编之事！在本王走后这么多年，本王不知道留守军队是否一直保持着勤加操练的规定，军纪上是否有放松，军械装备是否每年更换？这些本王都不清楚，本王也没有在这段时间去各地巡视，以前不管怎么样，本王不管了，但从现在开始要进行整编整训，不但留守军队需要整编整训，就连这次本王带回来的军队也需要加大力度进行操练，以尽快适应沙漠、河流、丘陵、山林等各种地形的作战情况，你们有没有问题？”
大将们哪敢说有问题、要反对？就算以前放松了，这个时候也应该抓紧了，于是大将们纷纷表示没问题，一定配合军机院进行整编和整训，一些年纪大的士卒或有伤患在身的兵卒肯定要被要求退役。
赵子良见大将们都没有意见，就接着说道：“好，这次整编一方面是在编制上进行整编，第二是为了淘汰弱兵，整训也是为了加强战力，第三是对军纪方面进行巡查，有放松军纪的，要立即收紧口袋，你不收紧口袋，我就给你小鞋穿。整编之后，最大作战编制为军团，每个军团各有番号，视驻防地域和实际情况，每个军一般为一万两千八百人，有些只有九千，有些因为需要，所以兵力会相对多一些，待会你们会各自拿到整编计划，我给你们两个月的时间，两个月之后，我会依次去各地巡视，发现问题我是要打板子的，所以你们最好不要不当一回事！”
众将答应：“是，大王！”
现在整个西秦的兵马人数有十二万人，按照赵子良的计划，要整编成九个军团，因为骑兵训练困难，但在中亚的地形中，骑兵又是主要战斗部队，因此骑兵有八万人，步兵有四万人，这四万步兵平时虽然训练攻城，但以后作战如果没有必要一般不负责攻城事宜，攻城事宜由仆从军负责，这十二万人马主要负责野战和保卫西秦大地。
第一军团（勐虎）的军团长是赵虎；第二军团（蛟龙）的军团长是白孝德；第三军团（雄鹰）的军团长为李晟、第四军团（饿狼）的军团长为魏勐；第五军团（暴熊）的军团长是霍堪；第六军团（麒麟）的军团长是玄一；第七军团（朱雀）军团长是玄二；第八军团（玄武）的军团长是玄三；第九军团（狮王）的军团长是玄四。
除了这九个军团之外，另外还有三个军团护卫王宫安全，分别是护卫军团、近卫军团和龙卫军团，其中护卫军团和近卫军团各有五千人，而龙卫军团只有一千人，但这一千人是从全军之中抽调的身形高大壮硕、极为悍勇之人组成，全身披重铠、配备锋利横刀，是王宫最核心的守卫力量。这三个军团的组成并非是一成不变的，每隔两年就要进行重新编练，新的三个军团编练完成之后就会取代原来的三个军团护卫王宫的安全。
为了加强西秦的战争潜力，赵子良下令实行义务兵和募兵制相结合的征兵办法，义务兵实行三年制，一年的训练期和两年的服役期，年满之后通过考核之后可以留下成为职业兵，义务兵三年内只有生活补贴而没有军饷，职业兵有军饷，义务兵年满之后通不过考核则退役回家，义务兵是年满十八岁的成年男子必须要服兵役，这是强制性命令，不管是王室成员还是平民百姓，都一视同仁。
职业军人就暂时以这十二万人为基础，三年以后，每年会退役一部分，缺额则由义务兵中通过考核者补充进去，始终让职业军人的数量规模维持在十二万人左右。
当然，这是和平时期，在战争时期，义务兵完成训练之后也要上战场，如果兵力不足，则还要进行紧急动员，以前退役的军人都必须服从征召返回军队参加作战。
赵子良按照中原朝廷的规矩和习惯，每月初一和十五召开军政大员们商议解决军政大事，平日里则各自办公、处理公务，有重要的事务、无法解决和做主的事情则向他请示。以前的节度使府被他改称为王庭，而其他各中枢机构衙门则各自在恒逻斯城内找办公地点。
上元元年二月初一，军政主要大员聚集在王庭，参加小朝会，赵子良与众人一起商议决定军政大事。
“臣等拜见大王！”王庭之下的两院两卫一寺一府的主要大员看见赵子良走过来之后都下拜行礼。
“都免礼吧！”赵子良坐下后抬了抬手。
“谢大王！”
主要军政大员一共十人，都聚集在这里，分别是刘眺、独孤峻、高尚、岑参、高适、楚歌、李嗣业、郑三、赵虎、陈青。
赵子良问道：“这都半个月过去了，王庭中枢各衙门机构都组建得如何了？”
刘眺站出来拱手道：“启禀大王，政务院及其下属衙门机构已经全部组件完成，三天前就已经开始重新处理公务！”
接下来其他各中枢衙门机构的主要官员和将领都分别依次站出来禀报各自衙门的组建进度，基本上都完成了构架的组建，开始步入正轨。
赵子良听完之后说道：“很好，本王决定把昆凌都护府、池都护府、碎叶都护府和泰西都护府这四个建制之下的城池改为县制，一城为一县；另外把泰西都护府一分为二，把昭武九姓之地的粟特人居住之地设立为康居都护府，把吐火罗人居住之地设立为月氏都护府，如此一来就有五个都护府，每个都护府辖下的县有多有少，本着一城一县的原则，中枢其他衙门机构要迅速在各县派驻办事机构，在五个都护府治所的所在城池要设高级办事机构，称为某某厅，例如锦衣卫在萨末腱城要设锦衣卫厅；在县城设立中级办事机构，锦衣卫要在县城设立锦衣卫房；有些县还有好几个镇，锦衣卫也要在镇一级设立低级办事机构，称为锦衣卫所，其他各他们也是同样如此。政务衙门则无需这般称唿，直接叫都护府、某某县衙、某某镇。另外军机院也要在各级行政区设立办事机构用于驻军、征兵、抚恤等事宜。政务院要尽快把各级行政区的行政编制报上来，其他各中枢机构也要尽快把派出机构派到下面两级行政机构，都明白吗？”
众人抱拳拱手道：“明白！”
这时刘眺站出来道：“大王，以前我们只有五万多、不到六万兵马，现在我们多了近一倍的军队，军费开支会大大增加，这会给我们的财政带来很大的负担！”
赵子良问道：“那么你的意思呢？”
刘眺道：“臣下以为应该削减一些军队！”
赵子良看向郑三，问道：“按照我们现在的兵力人数，每年需要多少军费开支？”
郑三算了算，站出来抱拳道：“大王，如果每年都要更换装备，每年大约需要八百万贯！如果两年更换一次装备，则只需要五百万贯”。
赵子良又问刘眺：“刘大人，以前我们一直没有向当地居民百姓收过税，只向过路的商旅收税，去年的财政收入是九百万贯，本王没说错吧？”
刘眺道：“是的，大王！”
赵子良说道：“咱们统治这里已经这么多年了，却一文钱的税都没有向当地居民百姓征收过，我们从今年开始向当地居民征收赋税，不算过分吧？他们如果不交税，我们凭什么保护他们的人生安全？凭什么保护他们的财产安全？”
刘眺道：“大王既要征税，也是可行的，这么多年过去了，我们在这里的统治已经稳固下来，现在我们汉人的人数在这里占多数，只要汉人都交税，其他各族就不能不交税！”
“很好，你算算，如果我们收税，今年的财政收入可以达到多少？”
刘眺算了算，拱手道：“如果过往商旅的税收维持不变的情况下，大约可以收到两千五百万贯！”
赵子良又道：“本王用一千万贯维持军队数量和战斗力，以达到我们维持这里统治的目的，过分吗？”
“这既然大王这么说，臣下无异议！”
赵子良问道：“府库还有多少银钱？”
刘眺说道：“除去留守驻军军费开支和官员们的薪俸、官府办公费用等等，府库的账目上还剩下两千一百万贯！”
赵子良闻言笑道：“看来诸位大人都是能积攒财富之人，这么多年的税收除去你刚才说的这些开支，你们基本上没有乱花。这一点我要称赞你们，对你们表示感谢，但是我又要责怪你们，因为你们不明白，对于官府来说，钱是越用越有，官府如果把赋税积攒起来不用，百姓们去哪儿赚钱？各地每年出产的金银铜是有数量的，也会有损耗，你们把钱藏起来不用，老百姓就赚不到钱，钱需要流通才能发挥它的价值，明白吗？官府把钱花出去，老白西瓜赚到了钱才能买东西，商家才能生产和运输货物去卖给百姓，官府才能再收税，钱财流通的速度越快，官府收到的税收就越多，反之则相反。所以我们要把钱都花出去，让老百姓有钱赚，如何花？这就是我们接下来要说的问题了！”