三人互相认识一番后，希特隆两人了解到天桐想要去棱镜塔，所以为他带路。
柚丽嘉询问天桐是不是想要去挑战密阿雷道馆，如果是的话，自家哥哥就是那里的道馆训练家，
天桐摇了摇头表示不是，自己只是想去看一看全世界各种有名的塔，因为他是铁塔酒侍，并且也自我介绍说自己也是一位道馆训练家，是合众地区三曜市的三曜道馆的道馆训练家。
随后，由于天桐希望乘坐地铁以满足心愿，希特隆决定两人一同乘坐地铁。
但是，柚丽嘉乘坐的无人试验车却意外开走了，希特隆与天桐两人合力才救下了柚丽嘉，
随后，要去其他地方旅行的天桐便与希特隆兄妹俩告别。
而前去各种遗迹里调查的布拉塔诺博士有一天也独自来到一处遗迹里，这里有一支考古队正在发掘文物，并且身为宝可梦记者的三色堇也在这里进行采访。
因为这个地方的存在有可能证实卡洛斯神话的真实性，
并且这里各种各样的出土文物表明，古人曾经在这个遗迹上建立起奠定了如今的卡洛斯文明的城邦。
所以布拉塔诺博士不远千里也要赶过来调查，
已经先一步到这里调查过的三色堇告诉布拉塔诺博士，这座遗迹之所以会被发现，是因为卫星照片拍到了被树丛覆盖住的神殿。
这座遗迹有着一个跟卡洛斯传，xYZ的传说的故事，
不过目前还无法证实是古人的创作，还是在历史上真实发生过的事件。
这里还有一座栩栩如生的少女雕像，这个少女雕像叫做石瞳少女，艾菈。
三色堇认为这座雕像是后人看了史书的记载之后雕刻出来的，但布拉塔诺博士却认为这大概率是一个活生生的少女被直接变成了石像。
故事的梗概大概就是，
村子里的一个贫苦村民强恩跟村长的女儿艾菈坠入了爱河，虽然两人身份悬殊，但是两人都深爱着对方，不过艾菈的父亲，也就是村长一直反对两人的婚事。
有一天，葛吉花的祖先大预言家玛吉花，预言伊裴尔塔尔将会来到这个村子，在这里变成茧的形态的时候，会吸收附近所有人和宝可梦的生命能量。
于是村长便命令强恩去除掉伊裴尔塔尔，说如果他能成功，那就再也不反对他和艾菈的婚事。
强恩因为深爱着艾菈，当即就答应了下来，但是艾菈却不同意他去，毕竟对方是神兽，傻子都知道这是村长想让强恩去送死。
不过强恩还是执意要去，可他才刚准备出发，伊裴尔塔尔就来到了村子里，
强恩立刻挺身而出对抗，但他射出的弓箭完全伤不了伊裴尔塔尔，强恩让烈箭鹰使出蓄能焰袭，但还没冲过去就先被伊裴尔塔尔的一发归天之翼命中化作了石像，坠入了悬崖底下，下场可想而知。
为了保护强恩，艾菈也中了归天之翼，化作了一座石像，整个村子几乎都被伊裴尔塔尔给摧毁了。
吸收完生命能量的伊裴尔塔尔便化作了茧的模样沉睡了过去。
等到受伤倒地的强恩醒来的时候，面前只有一只守护着他的坐骑坐骑山羊，还有艾菈的石像，以及被摧毁得不成样子的村子。
抱着变成石像的艾菈，强恩跪地痛哭，
带着两只超能妙喵走过来的玛吉花告诉强恩，村子里侥幸存活下来的人都已经离开了这里，她自己也打算离开，
如果强恩想要让艾菈变回来的话，也许可以去找生命之神哲尔尼亚斯帮忙，
哲尔尼亚斯与伊裴尔塔尔是成对的传说中的宝可梦，它也许会有办法把艾菈变回来，
它化作大树的时候会赐予大地孕育生命的力量以及让贫瘠的土地重生。
至于哲尔尼亚斯的所在地，是一片如彩虹般闪耀的森林，有哲尔尼亚斯在的森林，里面的植物一定会长得欣欣向荣。
于是，强恩便从此踏上了寻找哲尔尼亚斯的旅程，但毕竟哲尔尼亚斯自己也是到处跑，所以强恩一直从青年找到中年，都没有找到哲尔尼亚斯。
有一天，强恩在一座枯萎的森林里遇见了一位年老的长者，他告诉强恩，哲尔尼亚斯原本就在这片森林里生活着，但是今天被军队给带走了。
强恩立刻意识到这就是这片森林里的树木会全部枯萎的原因，
经过一番打探之后，他得知带走哲尔尼亚斯的是附近的一个小国的国王，贝奥朗，
他这么做是为了自己一个人独霸生命之神哲尔尼亚斯孕育生命的能力。
但是当军队强行把哲尔尼亚斯给押回到城池里之后，虽然哲尔尼亚斯并没有反抗和攻击他们，却将自身化作一棵鹿角状的大树。
贝奥朗是一个自私，无情，贪婪的城主，他希望哲尔尼亚斯的力量能给自己的庭院的草木茂盛的力量。
然而事与愿违，他的庭院里变得更加荒芜。
贝奥朗见自己得不到生命之神的力量很是愤怒，便下令让士兵把这棵哲尔尼亚斯化身的巨树给烧了。
手下的大臣劝说贝奥朗不要这么做，这么做也许会惹怒这些传说中的宝可梦们，但是贝奥朗执意不听，贝奥朗表示这是他的东西，他爱怎么处置是他自己的事。
最终，士兵们还是一把火把这棵树给烧了。
强恩想要去阻止，但是士兵们根本就不让他靠近。
关键时刻，Z神驾到，它集结其附近的细胞，化身50%形态，将这座小国的王城全部摧毁，国王和士兵们死伤殆尽。
基格尔德解决了士兵之后，细胞就再次分散开来，
而这时哲尔尼亚斯也变回了本来的面貌，尽管强恩不停的在祈求哲尔尼亚斯帮助他，但哲尔尼亚斯并没有理会他，转身离去。
在这之后，强恩再度回到了故乡，并通开始在土地上播种，想要靠自己的力量来振兴故乡，
与此同时，强恩也开始在石板上刻下三只传说的宝可梦的样子以及在自己身上发生过的事情。